More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3257 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 347 aa  714    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  97.12 
 
 		 347 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  66.57 
 
 		 366 aa  501  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3807  oxidoreductase domain-containing protein  70.32 
 
 		 360 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  67.35 
 
 		 348 aa  492  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  65.51 
 
 		 348 aa  485  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  65.22 
 
 		 348 aa  482  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  64.01 
 
 		 348 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  63.58 
 
 		 348 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  63.42 
 
 		 352 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5496  oxidoreductase domain protein  63.19 
 
 		 345 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.025738 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5228  oxidoreductase domain protein  63.02 
 
 		 345 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596346  normal  0.783327 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4437  oxidoreductase domain-containing protein  59.7 
 
 		 349 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.902266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  48.92 
 
 		 349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  35.42 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  32.07 
 
 		 378 aa  142  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  33.78 
 
 		 371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  30.14 
 
 		 393 aa  139  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  31.81 
 
 		 377 aa  138  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  34.71 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  34.63 
 
 		 385 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  31.77 
 
 		 396 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  32.27 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  30.92 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  32.63 
 
 		 382 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 		 378 aa  126  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  31.58 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  40.78 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  29.82 
 
 		 388 aa  123  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  30.03 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  29.27 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  25.64 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  32.28 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  32.83 
 
 		 398 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  33.78 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  36.49 
 
 		 379 aa  119  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  30.14 
 
 		 369 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  28.26 
 
 		 373 aa  119  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  36.07 
 
 		 387 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  31.37 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  32.26 
 
 		 394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  30.04 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  32.46 
 
 		 387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  30.04 
 
 		 390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  30.98 
 
 		 384 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 		 381 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  31.73 
 
 		 383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.37 
 
 		 381 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  28.67 
 
 		 386 aa  115  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  36.63 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  32.71 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  31.39 
 
 		 398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.56 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  30.03 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  31.75 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  35.82 
 
 		 369 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 385 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 		 385 aa  113  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  27.11 
 
 		 378 aa  112  7.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  30.88 
 
 		 397 aa  112  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 		 381 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  28.03 
 
 		 381 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  29.19 
 
 		 378 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 		 381 aa  112  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  31.5 
 
 		 385 aa  112  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.06 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  30.42 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  29.93 
 
 		 359 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  34.58 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  31.39 
 
 		 409 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  30.16 
 
 		 393 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.55 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  28.73 
 
 		 366 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  32.33 
 
 		 387 aa  109  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  31.74 
 
 		 385 aa  109  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  29.65 
 
 		 387 aa  109  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  34.39 
 
 		 418 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  30.71 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  29.48 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  32.36 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  31.71 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  27.25 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  27.99 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  27.79 
 
 		 419 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  30.04 
 
 		 390 aa  106  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  24.67 
 
 		 380 aa  106  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  32.02 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  31.02 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.5 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  31.92 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  31.89 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>