More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0727 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
381 aa  788    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  47.24 
 
 
364 aa  361  1e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  43.62 
 
 
393 aa  342  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  42.37 
 
 
390 aa  330  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  41.53 
 
 
396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  41.25 
 
 
385 aa  317  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  41.53 
 
 
390 aa  314  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.53 
 
 
390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  41.21 
 
 
383 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  40.31 
 
 
395 aa  311  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  41.42 
 
 
389 aa  309  5e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  40.53 
 
 
381 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  39.53 
 
 
395 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  40.94 
 
 
384 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  40.8 
 
 
381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.27 
 
 
381 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  39.37 
 
 
394 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  39.79 
 
 
376 aa  298  8e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  38.83 
 
 
394 aa  298  8e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  41.55 
 
 
381 aa  298  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  39.26 
 
 
391 aa  296  4e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.63 
 
 
346 aa  296  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  38.32 
 
 
387 aa  296  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  41.16 
 
 
377 aa  295  7e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  39.9 
 
 
393 aa  292  8e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  39.95 
 
 
394 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  38.74 
 
 
396 aa  286  4e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  38.36 
 
 
378 aa  286  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.8 
 
 
391 aa  285  7e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  39.79 
 
 
373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  39.58 
 
 
378 aa  282  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  40.53 
 
 
371 aa  281  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  38.34 
 
 
387 aa  280  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  36.27 
 
 
387 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  36.07 
 
 
380 aa  276  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  39.26 
 
 
390 aa  275  9e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  37.01 
 
 
385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  34.92 
 
 
373 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  35.25 
 
 
399 aa  268  8e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  36.46 
 
 
382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  34.83 
 
 
389 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  35.53 
 
 
390 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  34.46 
 
 
396 aa  255  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  34.2 
 
 
395 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  35.53 
 
 
390 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  35.26 
 
 
390 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  35.96 
 
 
388 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  34.65 
 
 
389 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  34.04 
 
 
390 aa  247  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  34.22 
 
 
377 aa  247  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  34.83 
 
 
390 aa  245  9e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  35.26 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  35.53 
 
 
390 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  35.25 
 
 
390 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  35.53 
 
 
390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  35.53 
 
 
390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  34.48 
 
 
384 aa  242  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  30.71 
 
 
393 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  34.53 
 
 
407 aa  236  7e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  31.93 
 
 
377 aa  233  6e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  34.2 
 
 
392 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  31.93 
 
 
390 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  31.4 
 
 
377 aa  229  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  33.6 
 
 
378 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  35.26 
 
 
364 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  30.87 
 
 
377 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  30.75 
 
 
381 aa  172  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  28.54 
 
 
385 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  28.24 
 
 
386 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  31.45 
 
 
366 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  29.58 
 
 
375 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  29.37 
 
 
377 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 
384 aa  156  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  27.51 
 
 
382 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 
381 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 
383 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  27.39 
 
 
382 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  30.48 
 
 
384 aa  149  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 
380 aa  145  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
390 aa  145  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  27.55 
 
 
384 aa  142  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  26.86 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
378 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  28.04 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  32.18 
 
 
369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 
378 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
377 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  31.53 
 
 
348 aa  119  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 
369 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  27.45 
 
 
386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  30.28 
 
 
376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 
398 aa  116  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  27.07 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  25.73 
 
 
394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 
387 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  31.34 
 
 
348 aa  112  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  29.02 
 
 
371 aa  113  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>