More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0142 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  100 
 
 
348 aa  717    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  64.18 
 
 
347 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  63.58 
 
 
347 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  61.85 
 
 
348 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  61.52 
 
 
348 aa  443  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  61.22 
 
 
348 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  62.39 
 
 
366 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3807  oxidoreductase domain-containing protein  64.48 
 
 
360 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5496  oxidoreductase domain protein  61.49 
 
 
345 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.025738 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  60.47 
 
 
348 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5228  oxidoreductase domain protein  60.3 
 
 
345 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596346  normal  0.783327 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  59.88 
 
 
352 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4437  oxidoreductase domain-containing protein  59.7 
 
 
349 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.902266  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  47.32 
 
 
349 aa  330  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  33.99 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  32 
 
 
396 aa  143  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  33.21 
 
 
376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  34.98 
 
 
386 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  30.91 
 
 
388 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  37.93 
 
 
387 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  37.07 
 
 
387 aa  135  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  40.87 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  33.22 
 
 
385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 
369 aa  133  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  31.38 
 
 
377 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  38.36 
 
 
397 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  30.03 
 
 
390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  27.75 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 
382 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  36.49 
 
 
387 aa  126  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  38.81 
 
 
388 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  33.79 
 
 
403 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  37.99 
 
 
396 aa  122  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 
397 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  37.44 
 
 
419 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  32.29 
 
 
385 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  36.73 
 
 
387 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  29.3 
 
 
393 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  37.9 
 
 
398 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  31.27 
 
 
387 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  34.96 
 
 
409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  31.53 
 
 
381 aa  119  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 
353 aa  119  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 
385 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  32.27 
 
 
378 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  33.63 
 
 
389 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  28.76 
 
 
388 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 
385 aa  116  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.75 
 
 
386 aa  116  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  35.2 
 
 
398 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  38.5 
 
 
413 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 
381 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  33.64 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 
395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.43 
 
 
356 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  30.25 
 
 
382 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  30.6 
 
 
382 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  35.35 
 
 
379 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  32.23 
 
 
381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.7 
 
 
381 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  28.41 
 
 
395 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  31.05 
 
 
390 aa  113  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  32.29 
 
 
377 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  26.03 
 
 
378 aa  112  7.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 
390 aa  112  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  31.21 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.2 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.05 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  29.83 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  30.22 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  33.97 
 
 
385 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  31.28 
 
 
381 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.49 
 
 
346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  31.08 
 
 
373 aa  110  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  32.07 
 
 
398 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  27.71 
 
 
396 aa  109  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  26.26 
 
 
381 aa  109  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  31.45 
 
 
390 aa  109  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  32.2 
 
 
377 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 
387 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 
377 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  31.33 
 
 
359 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  30.18 
 
 
390 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 
377 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  30.66 
 
 
394 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  31.54 
 
 
366 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  30.99 
 
 
394 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  30.12 
 
 
383 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
418 aa  106  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  29.39 
 
 
380 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 
377 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  32.14 
 
 
381 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 
384 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  29.49 
 
 
364 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  32.38 
 
 
395 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 
367 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  25.87 
 
 
378 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>