More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1865 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
367 aa  763    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  30.48 
 
 
376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  30.29 
 
 
387 aa  156  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 
387 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  34.8 
 
 
371 aa  152  8.999999999999999e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  30.55 
 
 
396 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 
377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  29.37 
 
 
377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 
390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 
377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  29.37 
 
 
386 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 
387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  28.87 
 
 
396 aa  145  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 
387 aa  142  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  27.01 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  29.52 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  28.29 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 
388 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  29.09 
 
 
382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  25.84 
 
 
385 aa  136  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.51 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  27.51 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 
359 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  27.06 
 
 
377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 
382 aa  133  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  26.25 
 
 
388 aa  133  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  26.06 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  29.64 
 
 
388 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  40.81 
 
 
386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  28.76 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  26.93 
 
 
385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  28.32 
 
 
382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  27.93 
 
 
359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  28.9 
 
 
390 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  25.2 
 
 
370 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  28.64 
 
 
419 aa  126  8.000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  32.02 
 
 
388 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 
377 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 
385 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  25.33 
 
 
371 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  32.97 
 
 
398 aa  123  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  27.69 
 
 
371 aa  123  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  24.8 
 
 
378 aa  122  7e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  27.88 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  27.42 
 
 
371 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 
389 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 
398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  24.67 
 
 
370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  27.89 
 
 
382 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  26.34 
 
 
349 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  29.52 
 
 
370 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 
376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 
378 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 
393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  31.52 
 
 
398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  28.45 
 
 
373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  28 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 
389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  24.87 
 
 
381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  26.2 
 
 
374 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  25.48 
 
 
363 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  34.44 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  27.39 
 
 
360 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.15 
 
 
356 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  30.91 
 
 
397 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  26.82 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  33.71 
 
 
396 aa  110  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 
384 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  30.88 
 
 
395 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 
397 aa  109  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  25.13 
 
 
386 aa  109  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 
347 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 
348 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  29.71 
 
 
366 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 
345 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 
356 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  30.24 
 
 
369 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 
389 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  26.96 
 
 
359 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  28.46 
 
 
352 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.84 
 
 
353 aa  105  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  30.79 
 
 
387 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  24.35 
 
 
381 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  27.87 
 
 
367 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  26.61 
 
 
348 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 
347 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 
373 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 
359 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 
390 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  32.18 
 
 
413 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  27.79 
 
 
409 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0185065 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 
372 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
340 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 
403 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  24.61 
 
 
380 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>