More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0546 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  100 
 
 
390 aa  797    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  99.42 
 
 
346 aa  707    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  94.62 
 
 
390 aa  737    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  77.97 
 
 
395 aa  614  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  77.22 
 
 
395 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  72.05 
 
 
393 aa  581  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  73.6 
 
 
394 aa  579  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  68.72 
 
 
381 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  68.72 
 
 
381 aa  532  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  66.84 
 
 
381 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  66.07 
 
 
396 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  65.72 
 
 
390 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  59.1 
 
 
394 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  57.29 
 
 
378 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  57.78 
 
 
384 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  57.33 
 
 
383 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  56.76 
 
 
381 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  53.81 
 
 
387 aa  398  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  50.13 
 
 
378 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  51.84 
 
 
393 aa  379  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  51.85 
 
 
394 aa  378  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  49.74 
 
 
390 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  48.94 
 
 
377 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  52.66 
 
 
391 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  49.07 
 
 
373 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  50.39 
 
 
387 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  49.74 
 
 
393 aa  359  4e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  46.68 
 
 
376 aa  359  5e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  46.68 
 
 
385 aa  355  8.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  49.47 
 
 
385 aa  354  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  46.81 
 
 
380 aa  354  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  47.37 
 
 
396 aa  354  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  48.11 
 
 
389 aa  353  4e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  47.92 
 
 
391 aa  350  3e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  51.6 
 
 
364 aa  346  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  46.88 
 
 
382 aa  344  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  45.89 
 
 
373 aa  342  9e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  45.03 
 
 
399 aa  341  1e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  47.66 
 
 
387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  47.75 
 
 
371 aa  333  3e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  44.68 
 
 
395 aa  325  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  45.79 
 
 
384 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  41.53 
 
 
381 aa  323  3e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  44.5 
 
 
377 aa  311  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  41.86 
 
 
396 aa  311  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  40.58 
 
 
390 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  39.79 
 
 
389 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  36.7 
 
 
377 aa  276  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  37.8 
 
 
364 aa  277  3e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  42.62 
 
 
407 aa  275  7e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  39.84 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  40.58 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  40.58 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  39.52 
 
 
390 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  36.6 
 
 
377 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  39.52 
 
 
390 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  40.48 
 
 
388 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  39.79 
 
 
390 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  37.33 
 
 
377 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  39.26 
 
 
390 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  37.11 
 
 
389 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  40.11 
 
 
378 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  37.14 
 
 
390 aa  256  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  37.43 
 
 
390 aa  253  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  37.93 
 
 
390 aa  253  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  37.01 
 
 
392 aa  246  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  32.59 
 
 
382 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  30.02 
 
 
385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  32.1 
 
 
384 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  32.09 
 
 
382 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  32.75 
 
 
386 aa  187  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  30.02 
 
 
381 aa  186  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 
381 aa  180  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  31.7 
 
 
374 aa  179  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  30.73 
 
 
390 aa  171  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  32.28 
 
 
366 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  30.42 
 
 
383 aa  166  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 
383 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  28.36 
 
 
380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 
384 aa  153  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  31.78 
 
 
384 aa  153  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 
382 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  25.81 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  31.62 
 
 
386 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  27.82 
 
 
384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 
394 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  29.34 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  32.35 
 
 
388 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  28.23 
 
 
398 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  27.82 
 
 
397 aa  127  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  29.61 
 
 
396 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  35.65 
 
 
369 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  31.37 
 
 
371 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  27.65 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  29.79 
 
 
382 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  30.48 
 
 
409 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0185065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>