More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3128 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  100 
 
 		 376 aa  778    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  59.84 
 
 		 377 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  58.36 
 
 		 378 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  57.22 
 
 		 385 aa  462  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  55.08 
 
 		 396 aa  428  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  55.47 
 
 		 391 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  53.76 
 
 		 390 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  54.4 
 
 		 387 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  51.72 
 
 		 395 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  52.15 
 
 		 389 aa  379  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  49.2 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  50 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  51.33 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  49.06 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  47.59 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  49.2 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  46.01 
 
 		 380 aa  362  9e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  49.2 
 
 		 382 aa  360  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  47.33 
 
 		 393 aa  351  8.999999999999999e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  48.94 
 
 		 378 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  47.12 
 
 		 390 aa  348  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.3 
 
 		 390 aa  344  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  46.83 
 
 		 394 aa  344  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  45.26 
 
 		 394 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  45.5 
 
 		 395 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  44.59 
 
 		 395 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  45 
 
 		 396 aa  332  8e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  45.36 
 
 		 385 aa  331  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.26 
 
 		 381 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  46.26 
 
 		 381 aa  330  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  41.64 
 
 		 399 aa  328  8e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  46.58 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  45.72 
 
 		 381 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.3 
 
 		 346 aa  325  6e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  44.85 
 
 		 383 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  43.8 
 
 		 384 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  43.62 
 
 		 373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  43.51 
 
 		 381 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  45.71 
 
 		 390 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  39.79 
 
 		 381 aa  298  8e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  42.28 
 
 		 378 aa  296  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  41.53 
 
 		 373 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  39.67 
 
 		 391 aa  286  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  43.5 
 
 		 364 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  40.81 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  37.77 
 
 		 389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  34.76 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  35.54 
 
 		 393 aa  239  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  37.5 
 
 		 390 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  36.6 
 
 		 390 aa  228  9e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  36.77 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  36.77 
 
 		 390 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  36.68 
 
 		 389 aa  226  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  36.7 
 
 		 390 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  36.44 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  36.59 
 
 		 407 aa  223  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  36.44 
 
 		 390 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  36.44 
 
 		 390 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  32.44 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  33.51 
 
 		 377 aa  222  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 390 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  36.44 
 
 		 390 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  35.28 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  35.28 
 
 		 390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  32.44 
 
 		 377 aa  212  9e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  33.77 
 
 		 392 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  30.23 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  31.95 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  31.37 
 
 		 366 aa  166  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  30.23 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  30.23 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  28.13 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 		 381 aa  155  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  28.46 
 
 		 384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  31.91 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  30.96 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 		 383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  30.34 
 
 		 390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  28.61 
 
 		 380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 		 383 aa  146  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  29.52 
 
 		 375 aa  143  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 		 377 aa  140  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 		 394 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 		 382 aa  126  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  30.61 
 
 		 388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 		 387 aa  116  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  28.61 
 
 		 396 aa  116  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  30.09 
 
 		 386 aa  116  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  26.63 
 
 		 370 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  33.79 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  30.56 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  30.98 
 
 		 379 aa  109  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 		 393 aa  109  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>