More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3060 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 383 aa  798    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  95.81 
 
 		 383 aa  769    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  72.77 
 
 		 384 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  70.76 
 
 		 380 aa  578  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  51.69 
 
 		 384 aa  411  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  49.74 
 
 		 385 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  47.24 
 
 		 381 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  47.24 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  45.71 
 
 		 384 aa  348  7e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  44.88 
 
 		 382 aa  344  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  44.65 
 
 		 382 aa  330  3e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  41.16 
 
 		 377 aa  326  5e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  40.11 
 
 		 366 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  38.83 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  39.05 
 
 		 374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  38.35 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  39.63 
 
 		 390 aa  257  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  38.68 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  37.73 
 
 		 382 aa  244  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  31.76 
 
 		 394 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.2 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  30.27 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.3 
 
 		 391 aa  170  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  30.33 
 
 		 387 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 		 380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  30.18 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  29.44 
 
 		 381 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  29.01 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  29.82 
 
 		 378 aa  163  6e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  28.61 
 
 		 371 aa  162  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  30.87 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  31.61 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  32.05 
 
 		 387 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 		 377 aa  159  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  30.87 
 
 		 377 aa  159  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  30.17 
 
 		 378 aa  159  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 378 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  28.61 
 
 		 378 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  28.93 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  30.42 
 
 		 396 aa  155  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  27.75 
 
 		 382 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  31.17 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  29.67 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 377 aa  154  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  28.32 
 
 		 376 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 		 377 aa  153  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.69 
 
 		 390 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 		 388 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  27.65 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  29.72 
 
 		 371 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  30.51 
 
 		 391 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  28.94 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.32 
 
 		 346 aa  151  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 		 384 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  29.14 
 
 		 390 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  28.82 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  29.46 
 
 		 371 aa  149  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  27.95 
 
 		 383 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  28.22 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  28.54 
 
 		 381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  28.13 
 
 		 396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  30.77 
 
 		 393 aa  146  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  29.5 
 
 		 376 aa  146  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  29.55 
 
 		 376 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  29.37 
 
 		 387 aa  145  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  29.85 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  29.72 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  26.6 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  30.91 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 		 378 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  28.64 
 
 		 419 aa  139  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 		 377 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  29.5 
 
 		 390 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.21 
 
 		 377 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 		 387 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  29.26 
 
 		 377 aa  139  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 		 397 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  29.98 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  29.93 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  28.61 
 
 		 364 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  26.55 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  31.07 
 
 		 390 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  30.13 
 
 		 396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  29.15 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  30.53 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  31.07 
 
 		 390 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  31.07 
 
 		 390 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  31.07 
 
 		 390 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  29.17 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>