More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4768 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 364 aa  722    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  56.02 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  56.49 
 
 		 381 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  55.95 
 
 		 381 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  55.35 
 
 		 378 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  56.76 
 
 		 387 aa  384  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  54.86 
 
 		 381 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  56.05 
 
 		 383 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  52.56 
 
 		 373 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  54.59 
 
 		 384 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  50.93 
 
 		 393 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  51.06 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  54.57 
 
 		 381 aa  362  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  51.83 
 
 		 394 aa  362  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  51.6 
 
 		 390 aa  344  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  50.39 
 
 		 395 aa  342  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  51.85 
 
 		 390 aa  342  9e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  54.84 
 
 		 390 aa  338  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  49.08 
 
 		 395 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  48.52 
 
 		 371 aa  330  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  46.05 
 
 		 390 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  45.7 
 
 		 380 aa  318  7e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  48.4 
 
 		 393 aa  315  9e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  49.13 
 
 		 346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  46.3 
 
 		 394 aa  310  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  44.68 
 
 		 377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  46.13 
 
 		 373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  43.5 
 
 		 376 aa  300  4e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.67 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  45.24 
 
 		 387 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  45.75 
 
 		 382 aa  297  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  46.42 
 
 		 385 aa  296  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  40.94 
 
 		 385 aa  295  8e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  45.14 
 
 		 378 aa  295  9e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  41.21 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  41.67 
 
 		 377 aa  286  5e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  41.82 
 
 		 395 aa  286  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  42.22 
 
 		 396 aa  285  9e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  45.09 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  44.3 
 
 		 384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  42.78 
 
 		 389 aa  283  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  42.59 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  42.26 
 
 		 387 aa  272  8.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  43.01 
 
 		 393 aa  271  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  37.87 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  43.12 
 
 		 378 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  38.4 
 
 		 377 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  35.26 
 
 		 381 aa  245  8e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  36.53 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  36.77 
 
 		 389 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  41.19 
 
 		 407 aa  225  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  36.94 
 
 		 388 aa  223  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  35.88 
 
 		 389 aa  219  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  36.94 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  36.94 
 
 		 390 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  37.83 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  35.81 
 
 		 390 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  35.81 
 
 		 390 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 392 aa  209  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  35.54 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  37 
 
 		 390 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  35.36 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  36.1 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  36.17 
 
 		 390 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  35.64 
 
 		 390 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  35.05 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  32.05 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  35.75 
 
 		 366 aa  169  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  32.86 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  34.11 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  32.47 
 
 		 374 aa  159  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  28.75 
 
 		 385 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  33.94 
 
 		 378 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  31.87 
 
 		 390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 		 381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  30.71 
 
 		 380 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  34.5 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  34.95 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  29.7 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  33.75 
 
 		 378 aa  142  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  32.41 
 
 		 419 aa  142  9e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  30.64 
 
 		 397 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  32.73 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  34.21 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  32 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  32.04 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  32.07 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  29.23 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  29.49 
 
 		 377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  29.7 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  32.01 
 
 		 387 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  26.43 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 		 384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 		 382 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>