More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_50260 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  81.49 
 
 
389 aa  677    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  100 
 
 
389 aa  800    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  74.81 
 
 
390 aa  624  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  74.81 
 
 
390 aa  620  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  74.55 
 
 
390 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  74.55 
 
 
390 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  76.35 
 
 
390 aa  609  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  75.06 
 
 
390 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  75.06 
 
 
390 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  75.06 
 
 
390 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  73.78 
 
 
390 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  69.67 
 
 
390 aa  583  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  70.95 
 
 
390 aa  571  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  70.08 
 
 
388 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  59.08 
 
 
392 aa  498  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  42.06 
 
 
391 aa  280  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  38.96 
 
 
393 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  39.48 
 
 
390 aa  277  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  40.1 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  38.79 
 
 
377 aa  265  7e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  39.43 
 
 
387 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  37.67 
 
 
377 aa  263  4.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  38.73 
 
 
377 aa  263  4.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  34.83 
 
 
381 aa  261  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  37.67 
 
 
381 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.4 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  38.62 
 
 
380 aa  253  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  35.54 
 
 
394 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  36.34 
 
 
381 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.11 
 
 
390 aa  249  6e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  36.06 
 
 
378 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  36.59 
 
 
389 aa  247  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  37.14 
 
 
383 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  36.87 
 
 
384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35 
 
 
391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  37.43 
 
 
394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  36.83 
 
 
395 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  36.83 
 
 
395 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  37.5 
 
 
371 aa  238  9e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  35.96 
 
 
387 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  35.79 
 
 
390 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  37.4 
 
 
382 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  35.25 
 
 
387 aa  237  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  34.61 
 
 
399 aa  236  4e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  38.05 
 
 
384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  33.51 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  36.01 
 
 
395 aa  233  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  39.53 
 
 
390 aa  233  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  36.53 
 
 
394 aa  232  9e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  35.17 
 
 
385 aa  232  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.45 
 
 
346 aa  232  9e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  36.22 
 
 
396 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  36 
 
 
381 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  34.22 
 
 
377 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  36.68 
 
 
376 aa  226  7e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  35.84 
 
 
393 aa  225  8e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  33.51 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  35.43 
 
 
373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  34.22 
 
 
377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  34.73 
 
 
393 aa  219  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  30.39 
 
 
364 aa  216  5.9999999999999996e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  35.37 
 
 
373 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  34.3 
 
 
378 aa  209  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  35.88 
 
 
364 aa  206  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  36.71 
 
 
407 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  34.03 
 
 
378 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 
375 aa  125  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  27.76 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  30.2 
 
 
374 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  31.29 
 
 
366 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.25 
 
 
385 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 
381 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 
390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  30.96 
 
 
383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  30.85 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 
381 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 
384 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  27.8 
 
 
382 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  25.81 
 
 
384 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  31.8 
 
 
369 aa  103  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  27.36 
 
 
380 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 
382 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  25.85 
 
 
384 aa  98.6  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  23.13 
 
 
377 aa  97.4  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  31.3 
 
 
394 aa  94  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 
378 aa  94  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  28.42 
 
 
382 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  32 
 
 
371 aa  93.2  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  30.94 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 
382 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 
384 aa  91.3  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  30.74 
 
 
378 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  31.18 
 
 
382 aa  89.4  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  31.93 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  34.26 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 
332 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
349 aa  88.2  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  34.76 
 
 
394 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.34 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  27.65 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>