More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1708 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  100 
 
 		 391 aa  809    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  59.06 
 
 		 396 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  54.03 
 
 		 385 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  57.95 
 
 		 378 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  55.47 
 
 		 376 aa  426  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  54.09 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  54.03 
 
 		 395 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  52.76 
 
 		 390 aa  403  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  55.61 
 
 		 387 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  53 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  50.65 
 
 		 394 aa  388  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  51.63 
 
 		 389 aa  385  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  49.47 
 
 		 380 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  48.96 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  49.08 
 
 		 377 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  51.06 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  49.6 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  49.19 
 
 		 382 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  46.61 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  47 
 
 		 393 aa  346  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  50.26 
 
 		 381 aa  345  6e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  49.74 
 
 		 381 aa  342  7e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  46.98 
 
 		 378 aa  342  7e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  48.95 
 
 		 381 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  47.42 
 
 		 396 aa  335  7.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  44.5 
 
 		 385 aa  335  7.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  47.38 
 
 		 387 aa  332  7.000000000000001e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  47.92 
 
 		 390 aa  329  6e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  47.01 
 
 		 394 aa  325  9e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  47.26 
 
 		 390 aa  322  8e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  46.89 
 
 		 395 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  45.29 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  42.97 
 
 		 399 aa  317  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  45.6 
 
 		 395 aa  315  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  44.24 
 
 		 373 aa  313  4.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  44.85 
 
 		 383 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  43.85 
 
 		 384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  43.2 
 
 		 378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  41.51 
 
 		 384 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.74 
 
 		 346 aa  299  5e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  45.09 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  38.8 
 
 		 381 aa  285  8e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  46.97 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  42.67 
 
 		 364 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  40 
 
 		 373 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  37.4 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  36.58 
 
 		 390 aa  256  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  37.93 
 
 		 390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  35.7 
 
 		 364 aa  252  9.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  35.09 
 
 		 389 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  36.48 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  36.48 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  36.48 
 
 		 390 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  35 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  32.38 
 
 		 377 aa  239  5.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  36.6 
 
 		 390 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  35.71 
 
 		 390 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  36.05 
 
 		 388 aa  238  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  35.54 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  36.7 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  35.71 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  32.02 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  33.6 
 
 		 377 aa  229  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  34.82 
 
 		 392 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  32.72 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  34.78 
 
 		 407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  31.56 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  31.22 
 
 		 383 aa  170  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 		 383 aa  170  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  31.37 
 
 		 384 aa  169  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  30.51 
 
 		 384 aa  167  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  32.47 
 
 		 366 aa  166  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.25 
 
 		 386 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  32.4 
 
 		 390 aa  156  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  31.64 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  28.75 
 
 		 380 aa  150  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 384 aa  146  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 		 381 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  31.62 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 		 394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  36.87 
 
 		 369 aa  132  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  29.36 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  28.12 
 
 		 419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  26.06 
 
 		 377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  31.76 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  30.68 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  26.25 
 
 		 370 aa  114  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  32.22 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  29.84 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 		 371 aa  109  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>