More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2348 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 399 aa  833    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  49.87 
 
 		 390 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  50.39 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  49.6 
 
 		 378 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  47.64 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  48.33 
 
 		 393 aa  357  2.9999999999999997e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  46.86 
 
 		 393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  46.74 
 
 		 385 aa  349  6e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  44.82 
 
 		 385 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  45.74 
 
 		 377 aa  345  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  49.22 
 
 		 389 aa  342  8e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  46.11 
 
 		 383 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  46.17 
 
 		 394 aa  339  5e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  45.74 
 
 		 396 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.65 
 
 		 381 aa  329  6e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  44.5 
 
 		 384 aa  329  7e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  41.64 
 
 		 376 aa  328  9e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  42.93 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  45.38 
 
 		 381 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  45.41 
 
 		 381 aa  325  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.03 
 
 		 390 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  44.59 
 
 		 381 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.97 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  45.24 
 
 		 395 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  45.69 
 
 		 387 aa  316  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  44.99 
 
 		 395 aa  316  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  43.23 
 
 		 378 aa  315  8e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  44.07 
 
 		 394 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  41.51 
 
 		 396 aa  310  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  43.41 
 
 		 387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  43.72 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  40.51 
 
 		 396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  40.67 
 
 		 384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  42.15 
 
 		 382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  40.89 
 
 		 395 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  43.3 
 
 		 346 aa  301  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  42.08 
 
 		 371 aa  294  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  41.82 
 
 		 373 aa  293  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  40.05 
 
 		 373 aa  285  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  39.3 
 
 		 377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  40.68 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  35.25 
 
 		 381 aa  268  8e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  41.21 
 
 		 364 aa  265  8.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  41.84 
 
 		 390 aa  262  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  37.96 
 
 		 378 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  37.08 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  32.73 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  35.38 
 
 		 389 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  33.77 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  34.61 
 
 		 389 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  34.29 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  35.14 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  35.71 
 
 		 390 aa  230  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  33.77 
 
 		 390 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  33.77 
 
 		 390 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  33.51 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  34.47 
 
 		 377 aa  227  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  33.51 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  32.99 
 
 		 390 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  32.99 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  34.03 
 
 		 377 aa  222  9e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  34.21 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  35.42 
 
 		 407 aa  219  6e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  33.85 
 
 		 390 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  32.99 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  31.54 
 
 		 392 aa  199  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  32.33 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  30.64 
 
 		 381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  32.43 
 
 		 382 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.63 
 
 		 385 aa  179  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 		 381 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  31.27 
 
 		 374 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  30.66 
 
 		 384 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.75 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  32.31 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  34.29 
 
 		 382 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  25.31 
 
 		 377 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  32.28 
 
 		 382 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 383 aa  147  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  29.7 
 
 		 384 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  30.49 
 
 		 384 aa  146  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  26.04 
 
 		 380 aa  145  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  33.58 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  32.78 
 
 		 369 aa  136  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 		 378 aa  135  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  27.93 
 
 		 375 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  26.1 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  31.65 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  31.99 
 
 		 371 aa  129  8.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 		 382 aa  129  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  31.99 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  32.7 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  30.04 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  30.94 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  29.57 
 
 		 387 aa  123  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>