More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3267 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
385 aa  783    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  72.03 
 
 
387 aa  558  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  62.7 
 
 
393 aa  455  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  59.15 
 
 
394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  54.83 
 
 
390 aa  423  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  51.86 
 
 
378 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  48.13 
 
 
377 aa  360  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  50.78 
 
 
396 aa  361  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  48.44 
 
 
389 aa  355  8.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  50 
 
 
381 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  48.95 
 
 
381 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  46.74 
 
 
399 aa  349  6e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  49.21 
 
 
381 aa  348  8e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  48.56 
 
 
384 aa  346  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  49.47 
 
 
381 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  46.42 
 
 
393 aa  345  7e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  48.82 
 
 
383 aa  344  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  49.21 
 
 
378 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  44.06 
 
 
385 aa  341  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  44.83 
 
 
396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  48.7 
 
 
387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  46.51 
 
 
394 aa  338  7e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.5 
 
 
391 aa  335  7.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  49.47 
 
 
390 aa  334  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  49.47 
 
 
390 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  45.36 
 
 
376 aa  331  1e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  43.98 
 
 
394 aa  331  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  48.03 
 
 
382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  45.27 
 
 
395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  45.05 
 
 
387 aa  326  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  44.68 
 
 
396 aa  319  5e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  45.08 
 
 
380 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  46.65 
 
 
395 aa  315  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  48.14 
 
 
346 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  43.35 
 
 
377 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  46.13 
 
 
395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  45.93 
 
 
373 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  45.41 
 
 
371 aa  305  8.000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  43.05 
 
 
384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  48.55 
 
 
390 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  43.65 
 
 
391 aa  291  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  45.89 
 
 
364 aa  277  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  37.01 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  39.63 
 
 
393 aa  266  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  41.89 
 
 
373 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  37.4 
 
 
377 aa  260  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  36.44 
 
 
377 aa  252  8.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  36.51 
 
 
377 aa  249  6e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  39.74 
 
 
378 aa  246  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  37.2 
 
 
389 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  37.14 
 
 
390 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  35.96 
 
 
388 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  32.11 
 
 
364 aa  233  5e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  36.97 
 
 
390 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  35.17 
 
 
389 aa  232  9e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  36.77 
 
 
390 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  36.77 
 
 
390 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  36.77 
 
 
390 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  36.5 
 
 
390 aa  229  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  36.7 
 
 
390 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  36.17 
 
 
390 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  36.95 
 
 
392 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  36.17 
 
 
390 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  38.03 
 
 
390 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  35.36 
 
 
390 aa  222  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  37.82 
 
 
407 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  34.5 
 
 
386 aa  199  9e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  31.46 
 
 
385 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  39.15 
 
 
366 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  34.16 
 
 
382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  32.02 
 
 
384 aa  182  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  34.41 
 
 
382 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  30.9 
 
 
381 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  31.39 
 
 
381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  32.69 
 
 
390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 
375 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 
383 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 
383 aa  149  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 
374 aa  149  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  37.37 
 
 
382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 
384 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  37.26 
 
 
369 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  31.7 
 
 
378 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  32.21 
 
 
394 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 
377 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 
384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  32.91 
 
 
384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  33.04 
 
 
382 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  35.56 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  29.36 
 
 
380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  32 
 
 
386 aa  129  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  31.88 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  31.39 
 
 
388 aa  127  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  31.59 
 
 
396 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 
377 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  30.19 
 
 
388 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  31.12 
 
 
388 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  35.33 
 
 
378 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.5 
 
 
348 aa  123  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  32.56 
 
 
376 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>