More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1585 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
375 aa  782    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.63 
 
 
381 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  32.37 
 
 
381 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  31.52 
 
 
373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  31.84 
 
 
381 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  31.44 
 
 
382 aa  189  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 
384 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  32.33 
 
 
371 aa  186  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  30.88 
 
 
396 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  33.53 
 
 
383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 
377 aa  182  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  28.73 
 
 
393 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  33.53 
 
 
384 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  31.02 
 
 
396 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  30.98 
 
 
380 aa  179  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 
394 aa  179  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  31.64 
 
 
378 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  32.16 
 
 
390 aa  176  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.56 
 
 
391 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  31.44 
 
 
385 aa  169  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  33.14 
 
 
391 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  29.14 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  31.85 
 
 
378 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  31.91 
 
 
394 aa  166  8e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  30.36 
 
 
381 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  31.23 
 
 
395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  28.61 
 
 
393 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.23 
 
 
390 aa  161  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  29.48 
 
 
377 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  30.66 
 
 
364 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  31.45 
 
 
377 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  29.29 
 
 
396 aa  159  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 
381 aa  159  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 
387 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  28.8 
 
 
389 aa  156  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  31.83 
 
 
407 aa  155  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  29.19 
 
 
373 aa  155  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 
387 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  28.34 
 
 
395 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  29.07 
 
 
385 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  29.38 
 
 
377 aa  150  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  29.04 
 
 
377 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 
395 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  28.84 
 
 
393 aa  149  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 
364 aa  145  9e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  31.75 
 
 
390 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  31.75 
 
 
390 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  31.75 
 
 
390 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.45 
 
 
346 aa  143  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  29.52 
 
 
376 aa  143  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 
387 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  31.19 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  31.87 
 
 
390 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  31.09 
 
 
390 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  31.29 
 
 
390 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  30.81 
 
 
390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  29.71 
 
 
390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  28.02 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  27.93 
 
 
399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  30.52 
 
 
390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  27.85 
 
 
389 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  27.11 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  27.65 
 
 
389 aa  125  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  28.16 
 
 
390 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  26.39 
 
 
392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 
378 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  25.72 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  27.47 
 
 
330 aa  86.7  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  25.5 
 
 
366 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  26.67 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  27.62 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  28.24 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  28.19 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  26.89 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
348 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  25.99 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  27.27 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  24.92 
 
 
384 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  25.72 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  25.67 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  28.81 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  24.46 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 
330 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  26.83 
 
 
330 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  25.23 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.43 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  23.37 
 
 
377 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  23.27 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  23.86 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  25.23 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  25.74 
 
 
331 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  24.64 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  28.57 
 
 
344 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  23.86 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>