More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0450 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  100 
 
 
396 aa  806    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  69.8 
 
 
393 aa  564  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  65.56 
 
 
394 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  66.07 
 
 
390 aa  518  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  65.82 
 
 
390 aa  518  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  65.65 
 
 
395 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  65.14 
 
 
395 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  64.91 
 
 
381 aa  498  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  64.64 
 
 
381 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  63.59 
 
 
381 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  66.29 
 
 
346 aa  485  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  55.04 
 
 
394 aa  457  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  57.88 
 
 
383 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  57.81 
 
 
384 aa  434  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  57.51 
 
 
387 aa  434  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  57.03 
 
 
378 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  57.29 
 
 
381 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  60.67 
 
 
390 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  53.16 
 
 
390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  55.38 
 
 
393 aa  395  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  50.66 
 
 
373 aa  391  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  53 
 
 
387 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  52.07 
 
 
391 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  49.87 
 
 
389 aa  366  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  49.48 
 
 
385 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  52.23 
 
 
394 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  47.91 
 
 
377 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  56.28 
 
 
364 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  50.78 
 
 
385 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  50.13 
 
 
378 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  47.53 
 
 
382 aa  360  3e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  49.08 
 
 
373 aa  359  5e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  47.12 
 
 
380 aa  355  6.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  46.23 
 
 
396 aa  347  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  49.61 
 
 
371 aa  345  7e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  48.7 
 
 
393 aa  344  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  47.42 
 
 
391 aa  341  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  45.74 
 
 
399 aa  339  5e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  45.41 
 
 
376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  47.55 
 
 
395 aa  334  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  47.18 
 
 
387 aa  331  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  41.53 
 
 
381 aa  325  6e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  45.89 
 
 
377 aa  324  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  44.76 
 
 
396 aa  324  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  45.19 
 
 
384 aa  308  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  40.1 
 
 
389 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  39.69 
 
 
389 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  36.77 
 
 
377 aa  275  7e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  40.78 
 
 
390 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  40.57 
 
 
388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  37.6 
 
 
377 aa  263  4.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  39.22 
 
 
390 aa  262  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  39.89 
 
 
378 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  38.86 
 
 
390 aa  259  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  39.95 
 
 
390 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  38.86 
 
 
390 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  38.86 
 
 
390 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  35.16 
 
 
364 aa  257  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  39.15 
 
 
390 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  38.08 
 
 
390 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  39.19 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  35.54 
 
 
377 aa  252  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  37.6 
 
 
390 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  38.46 
 
 
390 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  41 
 
 
407 aa  249  9e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  36.08 
 
 
392 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
384 aa  192  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  31.93 
 
 
386 aa  188  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  32.43 
 
 
381 aa  186  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  31.18 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  33.25 
 
 
382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  29.66 
 
 
385 aa  183  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  32.83 
 
 
382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  34.46 
 
 
366 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  29.88 
 
 
381 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 
374 aa  168  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  31.44 
 
 
390 aa  162  9e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 
383 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 
383 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  32.36 
 
 
382 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  29.82 
 
 
380 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 
384 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 
384 aa  142  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  28.05 
 
 
394 aa  136  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  26.96 
 
 
384 aa  135  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  30.38 
 
 
397 aa  133  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  32.21 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  24.88 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  29.93 
 
 
378 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  30.22 
 
 
386 aa  123  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  30.29 
 
 
382 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  31.23 
 
 
388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  29.64 
 
 
398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  28.06 
 
 
419 aa  117  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  30.36 
 
 
378 aa  116  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 
388 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 
377 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  27.34 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>