More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4610 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
380 aa  760    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  62.1 
 
 
382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  58.65 
 
 
371 aa  437  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  49.47 
 
 
391 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  51.48 
 
 
378 aa  378  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  47.63 
 
 
385 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  50.66 
 
 
387 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  46.01 
 
 
376 aa  362  9e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  46.28 
 
 
396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  46.48 
 
 
390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  50.13 
 
 
393 aa  353  2e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  44.97 
 
 
394 aa  352  8e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  48.94 
 
 
381 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  47.91 
 
 
396 aa  350  3e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  48.4 
 
 
381 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  48.54 
 
 
381 aa  348  7e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  45.99 
 
 
377 aa  348  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  47.56 
 
 
395 aa  348  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  47.12 
 
 
396 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  46.26 
 
 
393 aa  345  8.999999999999999e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  46.11 
 
 
378 aa  342  5.999999999999999e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  47.87 
 
 
394 aa  340  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  46.93 
 
 
383 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.81 
 
 
390 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  46.56 
 
 
377 aa  335  5.999999999999999e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  47.41 
 
 
389 aa  335  7e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  46.4 
 
 
384 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  45.74 
 
 
390 aa  330  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  44.39 
 
 
387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  42.93 
 
 
399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  45.79 
 
 
391 aa  325  6e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  47.38 
 
 
381 aa  325  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  46.48 
 
 
387 aa  325  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  45.67 
 
 
395 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  45.08 
 
 
385 aa  317  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  44.62 
 
 
395 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  44.47 
 
 
394 aa  317  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  44.51 
 
 
346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  45.21 
 
 
378 aa  309  5e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  45.7 
 
 
364 aa  301  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  49.74 
 
 
390 aa  300  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  42.32 
 
 
373 aa  299  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  42.51 
 
 
377 aa  288  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  42.04 
 
 
384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  40.7 
 
 
373 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  40.6 
 
 
377 aa  278  8e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  39.51 
 
 
377 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  36.07 
 
 
381 aa  276  6e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  32.62 
 
 
364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  38.62 
 
 
389 aa  253  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  36.77 
 
 
389 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  38.62 
 
 
390 aa  246  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  38.34 
 
 
390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  36.22 
 
 
393 aa  239  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  36.51 
 
 
390 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  36.07 
 
 
390 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  36.07 
 
 
390 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  36.6 
 
 
390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  35.81 
 
 
390 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  36.39 
 
 
388 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  36.46 
 
 
390 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  36.19 
 
 
390 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  36.9 
 
 
390 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  39.77 
 
 
407 aa  229  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  35.36 
 
 
390 aa  229  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  34.46 
 
 
392 aa  222  9e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  34.55 
 
 
366 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  30.98 
 
 
375 aa  179  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 
381 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 
385 aa  173  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  31.2 
 
 
386 aa  169  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 
383 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  31.39 
 
 
382 aa  166  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  32.76 
 
 
382 aa  166  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  31 
 
 
384 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
383 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  30.85 
 
 
374 aa  159  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  32.02 
 
 
384 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  34.29 
 
 
377 aa  152  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  27.89 
 
 
380 aa  149  9e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 
384 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  32.81 
 
 
377 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
377 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  28.97 
 
 
384 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  29.97 
 
 
390 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  33.6 
 
 
382 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 
377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.1 
 
 
377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  28.1 
 
 
377 aa  133  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  30.48 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  25.59 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  31.49 
 
 
382 aa  126  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  30.1 
 
 
369 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  26.9 
 
 
378 aa  124  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.8 
 
 
382 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  29.77 
 
 
394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  30.23 
 
 
371 aa  120  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  29.9 
 
 
371 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>