More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2787 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  80.76 
 
 		 395 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  80 
 
 		 395 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 394 aa  814    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  74.87 
 
 		 390 aa  605  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  73.6 
 
 		 390 aa  597  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  71.83 
 
 		 393 aa  594  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  74 
 
 		 346 aa  553  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  65.56 
 
 		 396 aa  537  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  66.75 
 
 		 381 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  66.49 
 
 		 381 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  66.49 
 
 		 381 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  66.93 
 
 		 390 aa  470  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  56.43 
 
 		 394 aa  457  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  57.51 
 
 		 378 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  54.4 
 
 		 383 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  53.63 
 
 		 384 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  51.04 
 
 		 390 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  51.79 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  52.8 
 
 		 381 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  49.34 
 
 		 373 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  50.79 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  50.66 
 
 		 378 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  50.65 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  51.05 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  49.48 
 
 		 394 aa  358  9.999999999999999e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  49.21 
 
 		 391 aa  355  5.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  45.83 
 
 		 385 aa  354  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  46.86 
 
 		 382 aa  352  7e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  46.19 
 
 		 376 aa  350  2e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  51.83 
 
 		 364 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  46.51 
 
 		 385 aa  350  3e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  46.32 
 
 		 373 aa  348  9e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  47.72 
 
 		 389 aa  347  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  47.52 
 
 		 396 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  47.8 
 
 		 387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  47.93 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  44.33 
 
 		 399 aa  330  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  44.47 
 
 		 380 aa  330  4e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  43.08 
 
 		 396 aa  324  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  45.41 
 
 		 395 aa  325  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  44.73 
 
 		 384 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  46.03 
 
 		 377 aa  322  7e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  45.05 
 
 		 371 aa  319  7e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  43.32 
 
 		 393 aa  316  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  39.95 
 
 		 381 aa  306  3e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  36.29 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  39.18 
 
 		 388 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  39.11 
 
 		 389 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  36.15 
 
 		 377 aa  265  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  40.73 
 
 		 378 aa  259  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  39.11 
 
 		 390 aa  258  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  38.32 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  37.43 
 
 		 389 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  38.89 
 
 		 390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  42.03 
 
 		 407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  38.06 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  39.37 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  38.85 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  38.85 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  35 
 
 		 377 aa  250  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  38.32 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  38.32 
 
 		 390 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  35.26 
 
 		 377 aa  245  8e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  37.08 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  36.48 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  35.75 
 
 		 390 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  32.93 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  31.5 
 
 		 386 aa  179  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  28.43 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  30.15 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  30.73 
 
 		 374 aa  167  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  30.39 
 
 		 382 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  30.93 
 
 		 390 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  29.24 
 
 		 381 aa  166  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  31.5 
 
 		 366 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 		 383 aa  156  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 		 384 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  31.41 
 
 		 382 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  29.98 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  28.82 
 
 		 380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 384 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  29.78 
 
 		 384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 		 394 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  26.16 
 
 		 377 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  28.54 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  29.34 
 
 		 377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  28.29 
 
 		 388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 		 380 aa  119  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  35 
 
 		 369 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  29.51 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  29.65 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.77 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  26.71 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  28.15 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  30.67 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 		 371 aa  109  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>