More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3006 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  97.12 
 
 		 347 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 347 aa  714    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3807  oxidoreductase domain-containing protein  69.74 
 
 		 360 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  65.99 
 
 		 366 aa  497  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  66.09 
 
 		 348 aa  488  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  64.93 
 
 		 348 aa  480  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  64.64 
 
 		 348 aa  477  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  64.18 
 
 		 348 aa  455  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  63.13 
 
 		 348 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  62.54 
 
 		 352 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5496  oxidoreductase domain protein  62.9 
 
 		 345 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.025738 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5228  oxidoreductase domain protein  62.72 
 
 		 345 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596346  normal  0.783327 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4437  oxidoreductase domain-containing protein  58.51 
 
 		 349 aa  378  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.902266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  48.92 
 
 		 349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  34.78 
 
 		 371 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  37.14 
 
 		 376 aa  146  5e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  32.61 
 
 		 377 aa  143  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 		 393 aa  142  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  32.25 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  33.51 
 
 		 382 aa  139  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  32.41 
 
 		 378 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  31.41 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 		 385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  30.86 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  32.15 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  31.56 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 		 386 aa  126  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  31.21 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  29.82 
 
 		 388 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  39.81 
 
 		 403 aa  122  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 388 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  29.34 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  32.17 
 
 		 373 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  36.53 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  34.78 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  30.53 
 
 		 397 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  33.6 
 
 		 387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  26.61 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 		 384 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  30.16 
 
 		 381 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  32.83 
 
 		 398 aa  119  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 390 aa  119  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.16 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  27.7 
 
 		 369 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  35.16 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 		 373 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  31.37 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.03 
 
 		 386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  32.17 
 
 		 383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  32.41 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  37.13 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.29 
 
 		 353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  35.98 
 
 		 387 aa  116  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 		 381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  32.04 
 
 		 409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.96 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  32.62 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  30.4 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  27.72 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  31.8 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  32.22 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  29.51 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  35.51 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  29.46 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  35.82 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 		 384 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 		 395 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 		 381 aa  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.3 
 
 		 390 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  30.56 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  28.73 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  32.17 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  30.34 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  30.26 
 
 		 359 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.79 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  29.88 
 
 		 394 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  32.25 
 
 		 387 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  32.11 
 
 		 418 aa  110  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  30.59 
 
 		 397 aa  109  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  32.12 
 
 		 376 aa  109  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  32.36 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  28.92 
 
 		 419 aa  109  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  27.14 
 
 		 390 aa  109  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  29.66 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  27.79 
 
 		 376 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  31.3 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  32.46 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.99 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  27.76 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  24.67 
 
 		 380 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  32.74 
 
 		 395 aa  106  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 		 377 aa  106  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  32.23 
 
 		 377 aa  105  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  31.54 
 
 		 387 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>