More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5570 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  100 
 
 		 366 aa  751    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3807  oxidoreductase domain-containing protein  75.28 
 
 		 360 aa  537  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  70.24 
 
 		 348 aa  499  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  66.57 
 
 		 347 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  69.94 
 
 		 348 aa  496  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  65.99 
 
 		 347 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  68.73 
 
 		 348 aa  496  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5228  oxidoreductase domain protein  66.57 
 
 		 345 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596346  normal  0.783327 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5496  oxidoreductase domain protein  66.27 
 
 		 345 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.025738 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  60.76 
 
 		 352 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  62.39 
 
 		 348 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  62.06 
 
 		 348 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4437  oxidoreductase domain-containing protein  56.6 
 
 		 349 aa  368  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.902266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  49.54 
 
 		 349 aa  329  5.0000000000000004e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  34.47 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  31.99 
 
 		 371 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  32 
 
 		 378 aa  136  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 		 377 aa  136  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 		 353 aa  133  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  36.25 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  33 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  34.12 
 
 		 386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  31.83 
 
 		 390 aa  126  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  31.21 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  31.91 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  30.34 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  33.33 
 
 		 396 aa  122  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 		 393 aa  122  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  32.46 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  30.38 
 
 		 390 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  32.88 
 
 		 387 aa  119  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  32.26 
 
 		 379 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  30.93 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 		 369 aa  117  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 399 aa  116  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  32.03 
 
 		 378 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  29.4 
 
 		 382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  30.77 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  31.27 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  33.63 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.86 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  33.04 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  28.31 
 
 		 387 aa  113  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  30.88 
 
 		 377 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  28.9 
 
 		 381 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  34.47 
 
 		 403 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  31.08 
 
 		 383 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  29.54 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  32.49 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  27.27 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  28.9 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.02 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  32.08 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  30.58 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  32.02 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  32.54 
 
 		 387 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  30.9 
 
 		 387 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  27.42 
 
 		 373 aa  109  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  25.71 
 
 		 378 aa  109  7.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 		 373 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  27.15 
 
 		 394 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 		 395 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  31.78 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  32.74 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  29.77 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  30.49 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  28.71 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.6 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  25.54 
 
 		 386 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  33.18 
 
 		 387 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 		 340 aa  106  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  34.45 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.92 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  26.88 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  32.04 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.92 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  26.29 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  29.5 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  30.23 
 
 		 395 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 		 381 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 383 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  26.74 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  28.11 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  26.57 
 
 		 383 aa  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  29.49 
 
 		 390 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 		 380 aa  103  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 		 347 aa  103  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  24.82 
 
 		 377 aa  102  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>