More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5496 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5496  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
345 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.025738 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5228  oxidoreductase domain protein  97.39 
 
 
345 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596346  normal  0.783327 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3807  oxidoreductase domain-containing protein  69.86 
 
 
360 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  66.27 
 
 
366 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  65.8 
 
 
348 aa  464  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  65.8 
 
 
348 aa  464  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  64.35 
 
 
348 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  63.19 
 
 
347 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  62.9 
 
 
347 aa  441  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  61.49 
 
 
348 aa  428  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  57.1 
 
 
352 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  57.4 
 
 
348 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4437  oxidoreductase domain-containing protein  56.93 
 
 
349 aa  361  9e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.902266  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  50.62 
 
 
349 aa  326  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  31.79 
 
 
376 aa  142  7e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  31.93 
 
 
378 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  31.94 
 
 
371 aa  140  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
396 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 
378 aa  135  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  36.02 
 
 
386 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  37.39 
 
 
382 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  30.71 
 
 
377 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  35.32 
 
 
387 aa  126  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  30.47 
 
 
386 aa  126  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  31.75 
 
 
397 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  37.82 
 
 
396 aa  123  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  30.2 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  31.13 
 
 
388 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 
385 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  30.57 
 
 
387 aa  119  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 
409 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  29.3 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  34.93 
 
 
398 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
386 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  34.91 
 
 
398 aa  116  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  35.07 
 
 
373 aa  116  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
387 aa  116  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  32.42 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  35.55 
 
 
379 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  33.19 
 
 
378 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  34.58 
 
 
396 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  29.51 
 
 
347 aa  113  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  33.49 
 
 
395 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  30.49 
 
 
403 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  29.35 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  33.02 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3305  oxidoreductase domain-containing protein  34.13 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0192693 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.22 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  30.63 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.06 
 
 
390 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.06 
 
 
346 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  30.88 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
390 aa  110  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 
387 aa  109  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  31.28 
 
 
381 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  31.9 
 
 
369 aa  109  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  33.66 
 
 
398 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  31.45 
 
 
390 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 
397 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  30.84 
 
 
381 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  33.48 
 
 
419 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 
378 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 
390 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 
399 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  33.17 
 
 
364 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  34.38 
 
 
413 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  28.72 
 
 
382 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  30.63 
 
 
378 aa  106  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  29.52 
 
 
381 aa  106  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 
381 aa  106  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 
373 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  30.74 
 
 
394 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  32.69 
 
 
383 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 
389 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 
389 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  29.67 
 
 
393 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  31.6 
 
 
384 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  28.27 
 
 
382 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 
364 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.81 
 
 
356 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 
370 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  32.21 
 
 
396 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  29.54 
 
 
377 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  29.21 
 
 
389 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  28.57 
 
 
377 aa  102  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  33.65 
 
 
371 aa  102  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.75 
 
 
353 aa  102  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  29.36 
 
 
377 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  32.06 
 
 
378 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  31.22 
 
 
387 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  31.73 
 
 
394 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 
370 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 
384 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  30.81 
 
 
394 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  31.84 
 
 
340 aa  99.8  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  25.52 
 
 
385 aa  99.8  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  25.53 
 
 
380 aa  99.8  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>