More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4863 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 387 aa  790    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  72.03 
 
 		 385 aa  558  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  66.84 
 
 		 393 aa  500  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  66.14 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  56.25 
 
 		 390 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  55.32 
 
 		 378 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  52.53 
 
 		 377 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  49.47 
 
 		 385 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  52.63 
 
 		 389 aa  391  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  48.56 
 
 		 396 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  53 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  49.6 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  47.59 
 
 		 376 aa  369  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  47.64 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  50.66 
 
 		 380 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  49.87 
 
 		 393 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  50.65 
 
 		 394 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  50.66 
 
 		 381 aa  362  9e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  51.19 
 
 		 381 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  48.83 
 
 		 395 aa  359  5e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  50.4 
 
 		 381 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  50.39 
 
 		 390 aa  355  8.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  50.91 
 
 		 390 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  51.19 
 
 		 382 aa  351  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  48.19 
 
 		 387 aa  349  6e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  47.93 
 
 		 378 aa  347  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  50 
 
 		 395 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  47.33 
 
 		 377 aa  346  4e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  46.3 
 
 		 394 aa  345  8e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  48.56 
 
 		 384 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  48.83 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  48.81 
 
 		 383 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  45.57 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  48.72 
 
 		 387 aa  334  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  46.75 
 
 		 391 aa  333  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  47.76 
 
 		 371 aa  333  3e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  50.14 
 
 		 346 aa  333  3e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  47.58 
 
 		 381 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  51.85 
 
 		 390 aa  323  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  43.92 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  44.56 
 
 		 373 aa  306  6e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  38.32 
 
 		 381 aa  296  5e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  45.24 
 
 		 364 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  42.36 
 
 		 378 aa  280  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  42.33 
 
 		 373 aa  278  8e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  40.9 
 
 		 393 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  35.86 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  37.14 
 
 		 377 aa  260  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  37.47 
 
 		 377 aa  259  7e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  35.98 
 
 		 377 aa  256  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  38.34 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  36.2 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  41.01 
 
 		 407 aa  239  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  35.96 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  36.6 
 
 		 390 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  36.22 
 
 		 390 aa  236  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  35.66 
 
 		 392 aa  235  8e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  34.45 
 
 		 388 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  35.28 
 
 		 390 aa  232  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  36.48 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  36.48 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  36.48 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  36.51 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  35.54 
 
 		 390 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  35.54 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  36.41 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  31.39 
 
 		 386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  33.09 
 
 		 384 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  31.84 
 
 		 382 aa  176  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  35.66 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  30.33 
 
 		 383 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  32.83 
 
 		 374 aa  166  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  30.33 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 		 375 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  30.93 
 
 		 390 aa  157  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  29.56 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  30.5 
 
 		 380 aa  153  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  33.85 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  36.25 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  34.31 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  32.28 
 
 		 384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 		 377 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 		 384 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  30.02 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  35.74 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  29.21 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  29.21 
 
 		 377 aa  129  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 		 378 aa  126  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  31.27 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  32.29 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  27.86 
 
 		 378 aa  124  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  29.27 
 
 		 397 aa  122  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  31.77 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  30.02 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  26.87 
 
 		 419 aa  119  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>