More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1310 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  85.38 
 
 		 390 aa  679    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  94.62 
 
 		 390 aa  761    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  97.95 
 
 		 390 aa  786    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  94.87 
 
 		 390 aa  734    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 390 aa  804    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  94.87 
 
 		 390 aa  734    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  93.59 
 
 		 390 aa  732    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  79.49 
 
 		 390 aa  654    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  95.13 
 
 		 390 aa  738    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  74.55 
 
 		 389 aa  616  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  76.15 
 
 		 390 aa  599  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  72.24 
 
 		 389 aa  591  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  69.49 
 
 		 390 aa  580  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  72.11 
 
 		 388 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  56.78 
 
 		 392 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  38.95 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  38.95 
 
 		 377 aa  272  9e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  38.68 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  43.68 
 
 		 391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  39.63 
 
 		 383 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  38.89 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  38.86 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.52 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  38.26 
 
 		 384 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  39.26 
 
 		 390 aa  253  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.23 
 
 		 381 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  38.08 
 
 		 396 aa  249  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  35.53 
 
 		 381 aa  249  5e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  36.97 
 
 		 381 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  39.58 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  35.01 
 
 		 394 aa  246  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.04 
 
 		 346 aa  246  6.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  36.17 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  38.32 
 
 		 394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  36.34 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  38.22 
 
 		 395 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  37.23 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  35.4 
 
 		 387 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.71 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  37.96 
 
 		 384 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  37.43 
 
 		 395 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  36.41 
 
 		 385 aa  231  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  37.04 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  36.19 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  36.77 
 
 		 376 aa  227  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  36.17 
 
 		 385 aa  227  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  32.99 
 
 		 399 aa  227  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  36.53 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  35.54 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  35.23 
 
 		 389 aa  224  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  34.39 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  36.48 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  34.93 
 
 		 373 aa  216  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  35.23 
 
 		 395 aa  215  9e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  34.93 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  35.39 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  33.42 
 
 		 396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  38.97 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  37.85 
 
 		 407 aa  213  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 		 364 aa  212  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  34.04 
 
 		 378 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  35.9 
 
 		 393 aa  209  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  33.6 
 
 		 396 aa  209  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  35.64 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  35.25 
 
 		 378 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  31.87 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.62 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 		 383 aa  123  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  30.62 
 
 		 366 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  27.39 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  27.11 
 
 		 386 aa  111  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  28.12 
 
 		 384 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  28.41 
 
 		 380 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  24.87 
 
 		 384 aa  106  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  26.77 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  26.8 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  31.36 
 
 		 370 aa  99.4  9e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  28.47 
 
 		 382 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  29.96 
 
 		 371 aa  93.2  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  29.96 
 
 		 371 aa  93.2  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.95 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  28.76 
 
 		 369 aa  91.3  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 		 382 aa  90.5  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  31.51 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  25.42 
 
 		 359 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  29.72 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  29.37 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.927102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>