More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1408 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  85.38 
 
 
390 aa  677    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  94.1 
 
 
390 aa  753    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  96.67 
 
 
390 aa  780    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  94.1 
 
 
390 aa  736    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  98.97 
 
 
390 aa  795    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  95.13 
 
 
390 aa  761    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  98.97 
 
 
390 aa  795    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
390 aa  803    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  79.49 
 
 
390 aa  653    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  75.06 
 
 
389 aa  624  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  76.15 
 
 
390 aa  600  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  72.49 
 
 
389 aa  596  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  70.51 
 
 
390 aa  589  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  72.37 
 
 
388 aa  577  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  56.78 
 
 
392 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  43.31 
 
 
391 aa  281  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  39.05 
 
 
377 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  39.58 
 
 
377 aa  276  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  38.52 
 
 
377 aa  271  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  39.9 
 
 
390 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  40.05 
 
 
393 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  39.84 
 
 
383 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.05 
 
 
390 aa  261  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  40.36 
 
 
387 aa  260  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  39.38 
 
 
396 aa  260  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  38.03 
 
 
381 aa  256  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  35.98 
 
 
394 aa  255  9e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  38.52 
 
 
384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.03 
 
 
381 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.48 
 
 
391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  35.53 
 
 
381 aa  251  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  39.52 
 
 
390 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  37.23 
 
 
381 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  36.07 
 
 
378 aa  245  9e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.04 
 
 
346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  38.98 
 
 
381 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  38.22 
 
 
384 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  38.32 
 
 
394 aa  242  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  35.66 
 
 
387 aa  242  9e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  35.75 
 
 
385 aa  242  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  36.6 
 
 
380 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  37.01 
 
 
394 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  38.48 
 
 
395 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  36.48 
 
 
387 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  36.77 
 
 
385 aa  236  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  37.04 
 
 
393 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  36.7 
 
 
382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  37.7 
 
 
395 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  33.51 
 
 
399 aa  232  7.000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  34.22 
 
 
396 aa  230  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  35.23 
 
 
389 aa  229  7e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  35.19 
 
 
377 aa  227  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  36.7 
 
 
376 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  36.01 
 
 
395 aa  227  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  34.38 
 
 
396 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  36.03 
 
 
393 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  40.26 
 
 
390 aa  219  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  37.01 
 
 
373 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  35.47 
 
 
377 aa  216  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  35.11 
 
 
371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  34.13 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  34.04 
 
 
378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  37.82 
 
 
407 aa  212  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  30.39 
 
 
364 aa  212  9e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  36.41 
 
 
364 aa  196  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  34.82 
 
 
378 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  31.95 
 
 
375 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  31.36 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.87 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  31.62 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 
384 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  27.41 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  25.54 
 
 
381 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  27.68 
 
 
390 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  29.12 
 
 
374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  27.8 
 
 
384 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  28.69 
 
 
380 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  25.41 
 
 
384 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  29.18 
 
 
384 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 
382 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  31.36 
 
 
370 aa  99.4  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  26.51 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  29.32 
 
 
369 aa  97.8  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 
382 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  30.35 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  30.35 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 
378 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.51 
 
 
382 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  26.87 
 
 
382 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  29.83 
 
 
396 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 
386 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  31.39 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 
394 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  28.42 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  24.69 
 
 
388 aa  84  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  26.92 
 
 
419 aa  83.6  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>