More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0362 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 396 aa  826    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  59.06 
 
 		 391 aa  476  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  55.61 
 
 		 385 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  57.41 
 
 		 378 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  54.23 
 
 		 377 aa  432  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  55.08 
 
 		 376 aa  428  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  52.59 
 
 		 395 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  54.03 
 
 		 387 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  51.06 
 
 		 390 aa  402  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  48.57 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  49.21 
 
 		 394 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  49.87 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  48.56 
 
 		 387 aa  378  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  49.09 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  48.68 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  48.81 
 
 		 393 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  48.18 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  46.28 
 
 		 380 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  48.42 
 
 		 382 aa  355  7.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  46.34 
 
 		 389 aa  354  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  47.38 
 
 		 387 aa  350  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  48.4 
 
 		 381 aa  345  7e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  48.67 
 
 		 381 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  48.67 
 
 		 381 aa  343  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  46.23 
 
 		 396 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  44.83 
 
 		 385 aa  340  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  47.75 
 
 		 390 aa  332  8e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  46.95 
 
 		 390 aa  327  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  45.95 
 
 		 378 aa  326  5e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  46.34 
 
 		 394 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  44.65 
 
 		 383 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  46.6 
 
 		 395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  46.6 
 
 		 395 aa  319  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  43.86 
 
 		 384 aa  315  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  41.51 
 
 		 399 aa  310  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  43.73 
 
 		 381 aa  308  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  42.52 
 
 		 391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.66 
 
 		 346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  42.33 
 
 		 373 aa  296  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  47.75 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  38.74 
 
 		 381 aa  286  5e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  40.11 
 
 		 378 aa  286  5.999999999999999e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  38.13 
 
 		 384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  41.95 
 
 		 364 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  40.26 
 
 		 373 aa  266  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 364 aa  254  3e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  33.25 
 
 		 393 aa  242  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  31.78 
 
 		 377 aa  237  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  30.69 
 
 		 377 aa  233  6e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  34.3 
 
 		 389 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  34.48 
 
 		 390 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  34.76 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  34.22 
 
 		 390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  34.22 
 
 		 390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  34.22 
 
 		 390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  35.28 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  33.51 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  33.95 
 
 		 390 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  30.95 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  32.72 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  33.42 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  34.22 
 
 		 390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  32.9 
 
 		 392 aa  209  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  33.25 
 
 		 390 aa  205  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  31.07 
 
 		 390 aa  202  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  30.9 
 
 		 407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  30.62 
 
 		 385 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 		 375 aa  159  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  28.92 
 
 		 380 aa  149  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 		 374 aa  149  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  28.78 
 
 		 382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  27.79 
 
 		 382 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  26.65 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  26.45 
 
 		 381 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 		 384 aa  136  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 		 377 aa  132  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  29.51 
 
 		 366 aa  129  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  26.84 
 
 		 386 aa  129  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  30.3 
 
 		 369 aa  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  27.14 
 
 		 384 aa  123  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  27.47 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 		 387 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 377 aa  109  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  31.55 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 		 352 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  29.72 
 
 		 347 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  29.71 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  30.09 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  27.7 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  26.17 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  27.03 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  26.48 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>