More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1983 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
407 aa  805    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  44.15 
 
 
390 aa  293  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  44.5 
 
 
391 aa  288  8e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  43.7 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  43.43 
 
 
390 aa  282  7.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  42.82 
 
 
393 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.97 
 
 
381 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  41.98 
 
 
396 aa  275  8e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  42.7 
 
 
381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  40.49 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  42.67 
 
 
394 aa  273  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  42.29 
 
 
383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  42.74 
 
 
395 aa  269  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  39.68 
 
 
385 aa  268  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  43.83 
 
 
346 aa  268  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  40.11 
 
 
377 aa  267  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  40.9 
 
 
378 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  40.05 
 
 
384 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  41.76 
 
 
384 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  35.2 
 
 
381 aa  265  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  42.48 
 
 
395 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  39.84 
 
 
377 aa  265  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  41.08 
 
 
381 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  41.49 
 
 
381 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  40.35 
 
 
377 aa  260  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  41.35 
 
 
387 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  42.63 
 
 
387 aa  257  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  40.21 
 
 
373 aa  255  9e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  39.46 
 
 
378 aa  253  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  38.61 
 
 
377 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  45.6 
 
 
390 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  40.22 
 
 
380 aa  250  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  39.62 
 
 
394 aa  249  4e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  40.16 
 
 
393 aa  249  7e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  40.05 
 
 
389 aa  246  6.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  38.77 
 
 
388 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  36.08 
 
 
399 aa  242  7.999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  39.68 
 
 
390 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  39.47 
 
 
371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  38.24 
 
 
373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  38.8 
 
 
382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  38.3 
 
 
390 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  38.56 
 
 
390 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  37.6 
 
 
376 aa  239  6.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  38.3 
 
 
390 aa  239  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  38.56 
 
 
390 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  39.85 
 
 
396 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  38.5 
 
 
393 aa  238  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  38.3 
 
 
390 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  38.3 
 
 
390 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  38.92 
 
 
385 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  42.22 
 
 
364 aa  236  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  38.73 
 
 
390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  38.03 
 
 
387 aa  236  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  38.54 
 
 
390 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  38.18 
 
 
390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  32 
 
 
364 aa  229  4e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  37.43 
 
 
377 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  37.27 
 
 
389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  38.56 
 
 
390 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.86 
 
 
391 aa  219  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  37.43 
 
 
389 aa  216  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  36.24 
 
 
395 aa  215  9e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  31.89 
 
 
396 aa  206  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  32.71 
 
 
392 aa  201  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  34.32 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  32.34 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  32.61 
 
 
366 aa  143  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  25.69 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.74 
 
 
386 aa  129  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  28.39 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 
383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  28.04 
 
 
384 aa  123  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  28.7 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  26.58 
 
 
380 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  27.07 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  29.59 
 
 
382 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  25.31 
 
 
381 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 
394 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 
381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
382 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 
390 aa  104  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  25.78 
 
 
384 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  23.85 
 
 
377 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  26.19 
 
 
393 aa  96.7  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 
348 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 
385 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4437  oxidoreductase domain-containing protein  33.03 
 
 
349 aa  93.6  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.902266  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 
352 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 
347 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 
347 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 
380 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5496  oxidoreductase domain protein  29.81 
 
 
345 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.025738 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5228  oxidoreductase domain protein  29.81 
 
 
345 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596346  normal  0.783327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6241  oxidoreductase domain protein  33.99 
 
 
332 aa  86.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  33.18 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  30.8 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>