More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2825 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
391 aa  803    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  53.85 
 
 
381 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  53.32 
 
 
381 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  50.8 
 
 
393 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  51.8 
 
 
396 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  52.11 
 
 
383 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  51.72 
 
 
381 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  49.61 
 
 
390 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  52.66 
 
 
390 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  50.53 
 
 
384 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  51.72 
 
 
381 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  52.13 
 
 
390 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  46.17 
 
 
394 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  47.76 
 
 
378 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  49.21 
 
 
393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  45 
 
 
385 aa  358  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  49.21 
 
 
394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  48.28 
 
 
371 aa  352  5e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  49.61 
 
 
395 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  46.75 
 
 
387 aa  350  4e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  45.72 
 
 
377 aa  347  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  48.29 
 
 
395 aa  345  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  50.43 
 
 
346 aa  343  4e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  45.79 
 
 
380 aa  342  5.999999999999999e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  46.11 
 
 
387 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.29 
 
 
391 aa  336  3.9999999999999995e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  45.67 
 
 
382 aa  335  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  46.34 
 
 
378 aa  333  4e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  44.91 
 
 
394 aa  330  3e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  42.52 
 
 
396 aa  330  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  51.96 
 
 
390 aa  329  4e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  44.74 
 
 
377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  42.71 
 
 
396 aa  322  7e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  45.17 
 
 
387 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  44.42 
 
 
395 aa  318  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  44.56 
 
 
373 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  43.16 
 
 
389 aa  313  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  43.65 
 
 
385 aa  311  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  41.84 
 
 
377 aa  309  4e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  39.26 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  42.51 
 
 
377 aa  307  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  40.9 
 
 
377 aa  305  7e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  40 
 
 
376 aa  298  9e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  43.8 
 
 
390 aa  296  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  43.57 
 
 
390 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  43.57 
 
 
390 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  43.95 
 
 
384 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  43.01 
 
 
389 aa  292  8e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  42.06 
 
 
389 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  44.16 
 
 
388 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  40.68 
 
 
399 aa  291  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  42.37 
 
 
390 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  43.31 
 
 
390 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  43.5 
 
 
390 aa  289  7e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  41.6 
 
 
373 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  45.09 
 
 
364 aa  285  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  42.74 
 
 
393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  43.68 
 
 
390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  43.68 
 
 
390 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  43.09 
 
 
390 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  44.5 
 
 
407 aa  277  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  41.78 
 
 
390 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  41.22 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  42.06 
 
 
378 aa  269  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  39.01 
 
 
392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  32.89 
 
 
364 aa  239  4e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 
375 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  30.71 
 
 
385 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  34.63 
 
 
386 aa  176  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  31.36 
 
 
382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.54 
 
 
381 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  30.33 
 
 
382 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 
383 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 
383 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  31.87 
 
 
366 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  30.49 
 
 
384 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 
384 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 
374 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 
384 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 
380 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 
384 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 
390 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  32.26 
 
 
382 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  35.24 
 
 
369 aa  123  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  28.64 
 
 
370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  34.27 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  30.05 
 
 
378 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  32.9 
 
 
386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  30.31 
 
 
388 aa  117  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 
394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  31.17 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  32.39 
 
 
382 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  30.93 
 
 
382 aa  113  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  31.04 
 
 
397 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  31.37 
 
 
348 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 
387 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  31.02 
 
 
398 aa  110  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  29.93 
 
 
379 aa  109  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>