More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1488 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  94.09 
 
 		 389 aa  763    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 389 aa  807    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  37.82 
 
 		 377 aa  285  8e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  36.79 
 
 		 377 aa  282  8.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  36.01 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  37.28 
 
 		 377 aa  267  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.28 
 
 		 377 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  37.28 
 
 		 377 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  34.97 
 
 		 376 aa  255  9e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  34.38 
 
 		 388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  35.13 
 
 		 390 aa  253  6e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  37.01 
 
 		 376 aa  249  7e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  34.11 
 
 		 378 aa  245  9e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  37.11 
 
 		 376 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  35.31 
 
 		 373 aa  232  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  35.84 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  36.83 
 
 		 369 aa  230  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  33.33 
 
 		 371 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  34.79 
 
 		 390 aa  226  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  33.07 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  32.8 
 
 		 359 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  35.14 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  32.8 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  32.38 
 
 		 371 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  35.78 
 
 		 367 aa  209  5e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  32.98 
 
 		 394 aa  209  9e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  31.87 
 
 		 371 aa  206  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  35.19 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  32.63 
 
 		 380 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  33.07 
 
 		 387 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  33.25 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 		 372 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  34.52 
 
 		 398 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  31.44 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  32.64 
 
 		 419 aa  189  8e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  32.11 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  32.03 
 
 		 378 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  30.66 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  31.65 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 387 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  32.2 
 
 		 386 aa  176  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  32.57 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 		 395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1680  oxidoreductase domain-containing protein  33.78 
 
 		 372 aa  173  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 		 388 aa  172  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 		 386 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 		 387 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  32.7 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  32.2 
 
 		 389 aa  169  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  32.03 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 393 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  33.25 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  31.77 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  32.55 
 
 		 388 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  28.39 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  29.47 
 
 		 376 aa  160  5e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  28.05 
 
 		 385 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 		 403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  31.12 
 
 		 398 aa  156  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  32.12 
 
 		 371 aa  156  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  31.09 
 
 		 397 aa  156  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  28.61 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 381 aa  153  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 		 377 aa  153  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  29.53 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  28.17 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  31.23 
 
 		 398 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3604  oxidoreductase domain protein  29.64 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289297  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 		 386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  30.55 
 
 		 409 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0185065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  28.57 
 
 		 386 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  27.02 
 
 		 381 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  30.89 
 
 		 374 aa  137  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  29.37 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 		 418 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  28.11 
 
 		 382 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  28.08 
 
 		 378 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1811  oxidoreductase domain-containing protein  26.42 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.483948 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  25.06 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  28.64 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  30.15 
 
 		 384 aa  119  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 		 384 aa  119  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  27 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  29.28 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 		 373 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  27.93 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 		 384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  28.46 
 
 		 381 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.01 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>