More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2513 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  93.23 
 
 		 399 aa  779    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 399 aa  824    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  64.99 
 
 		 396 aa  531  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  60.81 
 
 		 397 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  62.44 
 
 		 396 aa  512  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  58.75 
 
 		 401 aa  495  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  40.46 
 
 		 347 aa  261  2e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1739  oxidoreductase domain protein  32.91 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0261  oxidoreductase-like  30.63 
 
 		 414 aa  136  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1884  oxidoreductase domain-containing protein  30.05 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4117  oxidoreductase domain-containing protein  30.37 
 
 		 414 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 		 386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  28.13 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  28.98 
 
 		 385 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0814  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 		 376 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 340 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  28.92 
 
 		 371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  26.49 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  28.23 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0394  oxidoreductase-like protein  27.94 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202174  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  28.65 
 
 		 371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0623  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.075929  normal  0.225724 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  31.23 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  28.87 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 		 387 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  27.61 
 
 		 387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 372 aa  110  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 		 347 aa  110  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  27.96 
 
 		 376 aa  109  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  32.74 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  36.06 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  27.11 
 
 		 367 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  32.65 
 
 		 338 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  28.65 
 
 		 378 aa  106  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  29.63 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  27.76 
 
 		 367 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  29.71 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  29.18 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  29.48 
 
 		 333 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  28.73 
 
 		 335 aa  99.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 		 326 aa  99.8  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 		 396 aa  99.8  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  25.9 
 
 		 359 aa  99.8  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  29.92 
 
 		 334 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  27.7 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3178  oxidoreductase domain protein  32.35 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  26.18 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  30.37 
 
 		 373 aa  98.6  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 		 371 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  25.88 
 
 		 371 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  28.34 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 334 aa  96.3  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  28.81 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  34.22 
 
 		 330 aa  95.1  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 		 338 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 		 377 aa  94  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  28.87 
 
 		 390 aa  94  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  26.56 
 
 		 386 aa  93.2  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  23.99 
 
 		 366 aa  93.6  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 		 377 aa  93.6  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  25.82 
 
 		 359 aa  93.2  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.29 
 
 		 355 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  27.51 
 
 		 397 aa  93.2  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  28.29 
 
 		 435 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 340 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3639  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671652  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  25.36 
 
 		 339 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  24.76 
 
 		 321 aa  92.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.7 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.7 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.49 
 
 		 335 aa  92  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  28.51 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  27.94 
 
 		 341 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  26.94 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  28.07 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  27.94 
 
 		 341 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.94 
 
 		 341 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 		 433 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 		 336 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.86 
 
 		 333 aa  90.5  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  28.53 
 
 		 349 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 		 382 aa  90.5  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  24.1 
 
 		 367 aa  90.1  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  27.9 
 
 		 332 aa  90.5  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  28.76 
 
 		 330 aa  90.1  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0302  oxidoreductase domain protein  23.74 
 
 		 393 aa  90.1  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00604537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>