More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1156 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  74.31 
 
 		 401 aa  648    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 396 aa  828    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  78.54 
 
 		 397 aa  673    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  62.44 
 
 		 399 aa  512  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  62.18 
 
 		 399 aa  509  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  56.71 
 
 		 396 aa  485  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  41.79 
 
 		 347 aa  272  9e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1739  oxidoreductase domain protein  33.67 
 
 		 414 aa  159  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0261  oxidoreductase-like  29.5 
 
 		 414 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0623  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 		 415 aa  133  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.075929  normal  0.225724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 		 386 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4117  oxidoreductase domain-containing protein  28.01 
 
 		 414 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0394  oxidoreductase-like protein  28.08 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202174  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0814  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1884  oxidoreductase domain-containing protein  27.91 
 
 		 402 aa  126  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 385 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  28.41 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.46 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  25.52 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 		 387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.63 
 
 		 366 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  26.46 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  26.72 
 
 		 376 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  25.14 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  26.58 
 
 		 377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  26.46 
 
 		 371 aa  110  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  24.87 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 		 353 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0302  oxidoreductase domain protein  25.2 
 
 		 393 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00604537  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  25.84 
 
 		 378 aa  106  6e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  26.16 
 
 		 367 aa  106  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  24.87 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  24.8 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 		 340 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  25.68 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  25.74 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 		 337 aa  102  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  24.8 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  25.32 
 
 		 376 aa  99.8  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  25.48 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 		 334 aa  98.6  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  26.9 
 
 		 386 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  26.64 
 
 		 335 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  28.63 
 
 		 333 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 359 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0643  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 		 404 aa  96.3  9e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.41 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  30.73 
 
 		 667 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  25.46 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.03 
 
 		 341 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  29.03 
 
 		 341 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 383 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  29.49 
 
 		 341 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.03 
 
 		 341 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  29.49 
 
 		 341 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  26.59 
 
 		 367 aa  94  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  24.73 
 
 		 334 aa  94  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  24.19 
 
 		 344 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  23.12 
 
 		 380 aa  94  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  26.98 
 
 		 342 aa  93.6  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 		 321 aa  92.8  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  25.95 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  28.24 
 
 		 362 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  23.86 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  22.79 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  29.03 
 
 		 287 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 		 342 aa  92  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  26.51 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  25.67 
 
 		 349 aa  91.3  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  25.48 
 
 		 370 aa  91.3  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0274  oxidoreductase domain protein  24.36 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 		 378 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  25.87 
 
 		 369 aa  91.3  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  27.43 
 
 		 341 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 		 333 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  26.07 
 
 		 343 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.32 
 
 		 369 aa  90.9  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 		 372 aa  90.5  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3178  oxidoreductase domain protein  26.86 
 
 		 337 aa  90.5  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  24.51 
 
 		 356 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  26.19 
 
 		 342 aa  89.7  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  26.24 
 
 		 390 aa  90.1  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  24.42 
 
 		 344 aa  89.7  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.44 
 
 		 333 aa  89.7  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  24.58 
 
 		 349 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  24.3 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  26.44 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 		 320 aa  88.6  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  25.6 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  25.32 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  24.74 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>