More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2457 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  89.53 
 
 		 383 aa  721    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 383 aa  788    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  63.78 
 
 		 381 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  67.2 
 
 		 382 aa  528  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4013  oxidoreductase domain protein  66.4 
 
 		 382 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  65.87 
 
 		 382 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  64.72 
 
 		 386 aa  514  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2881  oxidoreductase domain-containing protein  65.88 
 
 		 381 aa  509  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  62.96 
 
 		 385 aa  503  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  61.8 
 
 		 384 aa  496  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  63.16 
 
 		 380 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  59.63 
 
 		 384 aa  489  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  62.44 
 
 		 387 aa  490  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2017  oxidoreductase domain protein  64.08 
 
 		 384 aa  486  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0616  oxidoreductase domain-containing protein  61.82 
 
 		 387 aa  477  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1086  oxidoreductase domain protein  61.17 
 
 		 382 aa  472  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4009  oxidoreductase domain protein  61.15 
 
 		 381 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  59.22 
 
 		 387 aa  466  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  59.1 
 
 		 389 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  58.44 
 
 		 387 aa  467  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  58.31 
 
 		 389 aa  463  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  56.48 
 
 		 387 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  56.08 
 
 		 388 aa  412  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 396 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  33.33 
 
 		 369 aa  90.5  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 		 378 aa  89.4  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  31.21 
 
 		 387 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  29.71 
 
 		 396 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 		 352 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  24.07 
 
 		 374 aa  86.3  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  27.3 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  27.43 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  30.49 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  26.18 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  26.18 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  25.73 
 
 		 396 aa  82.8  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  22.79 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  30.4 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  27.7 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  26.65 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  28.15 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  31.02 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  30.04 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  32.02 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  26.35 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  31.46 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  26.34 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  27 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  31.51 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  28.44 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  31.42 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  27.19 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.83 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  28.86 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  26.37 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  31.52 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  25.81 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  26.64 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  25.74 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  26.39 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  26.53 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.51 
 
 		 333 aa  72.8  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.89 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 		 372 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01210  predicted dehydrogenase  30.4 
 
 		 319 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  30.59 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  24.09 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  25.28 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  25.74 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  27.75 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  27.23 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  30.66 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1260  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.140047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  27.12 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  29.96 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.17 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  24.23 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  26.17 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  28.04 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>