More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3331 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  89.01 
 
 		 382 aa  714    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4013  oxidoreductase domain protein  89.79 
 
 		 382 aa  718    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 382 aa  786    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  67.2 
 
 		 383 aa  528  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  66.67 
 
 		 383 aa  524  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  66.58 
 
 		 387 aa  522  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  62.86 
 
 		 381 aa  508  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0616  oxidoreductase domain-containing protein  64.84 
 
 		 387 aa  507  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  63.23 
 
 		 386 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  62.6 
 
 		 380 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  59.63 
 
 		 385 aa  472  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4009  oxidoreductase domain protein  61.27 
 
 		 381 aa  472  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2881  oxidoreductase domain-containing protein  61.9 
 
 		 381 aa  468  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  59.15 
 
 		 384 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  58.05 
 
 		 384 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  56.99 
 
 		 389 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1086  oxidoreductase domain protein  58.73 
 
 		 382 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  58.27 
 
 		 387 aa  451  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  56.96 
 
 		 389 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2017  oxidoreductase domain protein  58.62 
 
 		 384 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  58.49 
 
 		 387 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  54.86 
 
 		 387 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  56.69 
 
 		 388 aa  414  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 		 396 aa  90.9  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  30.8 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  25.07 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  25.94 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  30.37 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  26.63 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  29.04 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  23.17 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  25.78 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  25.17 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  31.12 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  26.16 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  24.69 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  27.1 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  26.77 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  25.31 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  25.88 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  26.04 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  25.77 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  25.2 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  23.42 
 
 		 394 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  30.04 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  32 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  22.99 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  23.98 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  28.11 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  26.1 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  27.98 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  24.07 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  24.56 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  24.34 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  24.07 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  25.81 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  23.35 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  26.72 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.95 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  33.96 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.46 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  22.92 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  28.51 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  27.31 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  25.1 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  25 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  25.1 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  24.02 
 
 		 367 aa  67  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  28.11 
 
 		 341 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.51 
 
 		 341 aa  67  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  28.11 
 
 		 341 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  26.32 
 
 		 330 aa  67  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  28.51 
 
 		 341 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  24.38 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  24.69 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  26.59 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>