More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0140 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 386 aa  788    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  67.63 
 
 		 384 aa  551  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  69.84 
 
 		 380 aa  545  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  65.88 
 
 		 384 aa  543  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2017  oxidoreductase domain protein  64.3 
 
 		 384 aa  525  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  64.72 
 
 		 383 aa  514  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  64.94 
 
 		 387 aa  512  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  64.66 
 
 		 389 aa  505  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  64.66 
 
 		 389 aa  504  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  62.3 
 
 		 383 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1086  oxidoreductase domain protein  65.61 
 
 		 382 aa  503  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4009  oxidoreductase domain protein  63.78 
 
 		 381 aa  497  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  63.23 
 
 		 382 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4013  oxidoreductase domain protein  62.43 
 
 		 382 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  60.68 
 
 		 387 aa  485  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  65.19 
 
 		 387 aa  487  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  61.38 
 
 		 382 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  59.84 
 
 		 381 aa  478  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  60.89 
 
 		 388 aa  460  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  57.18 
 
 		 385 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  58.7 
 
 		 387 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2881  oxidoreductase domain-containing protein  58.27 
 
 		 381 aa  446  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0616  oxidoreductase domain-containing protein  57.66 
 
 		 387 aa  435  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  28.69 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  30.64 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 		 380 aa  89.4  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  31.02 
 
 		 374 aa  87  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  24.77 
 
 		 374 aa  87  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  27.51 
 
 		 373 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  28.39 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  29.95 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  26.58 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  29.11 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  26.64 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  30.24 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  25.87 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  29.46 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  29.95 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  28.25 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  29.11 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  26.47 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  29.41 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  22.82 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  26.57 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  29.41 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  28.39 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  28.81 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  30.47 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  27.07 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  27.4 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  33.33 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  23.48 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3305  oxidoreductase domain-containing protein  31.63 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192693 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  25.7 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  26.03 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  26.01 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.94 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.82 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  25.44 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  28.24 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  25.82 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  31.4 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  27.75 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  29.36 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  27.07 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.68 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  27.45 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  26.16 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  23.38 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0290  oxidoreductase-like  29.79 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0348948  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  25.14 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  24.82 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  26.36 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  30.67 
 
 		 330 aa  67  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  24.57 
 
 		 396 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  26.8 
 
 		 369 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>