More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2407 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  776    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  81.17 
 
 		 377 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  80.9 
 
 		 377 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  81.43 
 
 		 377 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  69.41 
 
 		 388 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  61.7 
 
 		 379 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  47.86 
 
 		 382 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  47.33 
 
 		 382 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  47.73 
 
 		 366 aa  335  7.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  47.71 
 
 		 366 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  46.57 
 
 		 366 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  44.97 
 
 		 368 aa  316  4e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  43.51 
 
 		 367 aa  308  9e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  45.82 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  44.47 
 
 		 369 aa  299  5e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  45 
 
 		 374 aa  295  9e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  42.78 
 
 		 379 aa  293  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  43.13 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  42.33 
 
 		 365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  42.42 
 
 		 357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  41.8 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  40.85 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  42.7 
 
 		 357 aa  262  8e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  39.3 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  42.19 
 
 		 380 aa  259  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0776  oxidoreductase-like  39.95 
 
 		 391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  38.93 
 
 		 368 aa  256  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0066  oxidoreductase domain protein  40.21 
 
 		 379 aa  245  6.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  40.69 
 
 		 378 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  40 
 
 		 368 aa  245  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  40.87 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  38.46 
 
 		 372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  39.83 
 
 		 371 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  37.64 
 
 		 373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3721  oxidoreductase domain protein  40.71 
 
 		 373 aa  232  6e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387593  normal  0.0213172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  39.11 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5340  oxidoreductase domain protein  43.24 
 
 		 375 aa  229  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  38.7 
 
 		 379 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03860  predicted dehydrogenase  40.06 
 
 		 383 aa  220  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27520  predicted dehydrogenase  39.71 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2337  oxidoreductase domain protein  39.19 
 
 		 368 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1191  oxidoreductase domain protein  37.09 
 
 		 383 aa  210  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  normal  0.346869 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  33.06 
 
 		 356 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  34.33 
 
 		 358 aa  176  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  28.34 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  30.73 
 
 		 644 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  29.74 
 
 		 375 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 		 352 aa  133  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  26.72 
 
 		 364 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0519  aldo/keto reductase  32.54 
 
 		 665 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798148  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 		 363 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1993  aldo/keto reductase  30.34 
 
 		 657 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 385 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.4 
 
 		 378 aa  99.4  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.4 
 
 		 378 aa  99.4  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  25.73 
 
 		 378 aa  99.4  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 		 359 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 		 353 aa  93.2  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  28.92 
 
 		 376 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  28.29 
 
 		 370 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 		 370 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  26.81 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  29.48 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  26.43 
 
 		 388 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.06 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  24.33 
 
 		 345 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 		 383 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  28.98 
 
 		 377 aa  87  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 		 378 aa  86.7  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 		 353 aa  86.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 		 332 aa  86.3  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  27.05 
 
 		 376 aa  86.3  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 		 344 aa  86.3  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  30.91 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  27.64 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  27.05 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  26.63 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.11 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  27.64 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  26.86 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  23.06 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  29.58 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  28.93 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.18 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  23.99 
 
 		 359 aa  82.8  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  31.35 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  34.97 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  27.04 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.44 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  27.84 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>