More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3365 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
387 aa  787    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  75.84 
 
 
389 aa  628  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  75.32 
 
 
389 aa  625  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  78.44 
 
 
388 aa  610  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  74.94 
 
 
387 aa  598  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  64.94 
 
 
386 aa  512  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  64.92 
 
 
380 aa  501  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1086  oxidoreductase domain protein  63.61 
 
 
382 aa  500  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288482  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4009  oxidoreductase domain protein  63.38 
 
 
381 aa  493  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2017  oxidoreductase domain protein  64.08 
 
 
384 aa  490  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  61.5 
 
 
384 aa  485  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  62.34 
 
 
387 aa  482  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  59.79 
 
 
384 aa  483  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  59.22 
 
 
383 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  57.92 
 
 
383 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  58.27 
 
 
382 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4013  oxidoreductase domain protein  57.74 
 
 
382 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  56.69 
 
 
382 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  54.03 
 
 
381 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  54.03 
 
 
387 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0616  oxidoreductase domain-containing protein  53.75 
 
 
387 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  52.07 
 
 
385 aa  408  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2881  oxidoreductase domain-containing protein  54.55 
 
 
381 aa  405  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  25.21 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  22.84 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  28.84 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  25.31 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  26.46 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  22.89 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  25.62 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  24.49 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  24.72 
 
 
366 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  24.27 
 
 
373 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  26.75 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  29.06 
 
 
366 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  27.69 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  28.57 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  31.85 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  27.52 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  26.14 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  27.98 
 
 
366 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  25.65 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1762  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  25.41 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  25.75 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  26.36 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  26.13 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 
347 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  25.62 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  22.34 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  26.18 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  23.19 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2847  oxidoreductase domain-containing protein  28.7 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  29.56 
 
 
328 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  23.85 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 
372 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  24.28 
 
 
370 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  22.22 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.839284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  24.28 
 
 
370 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  25.2 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  22.22 
 
 
366 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.67 
 
 
350 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  24.48 
 
 
396 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  27.17 
 
 
343 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  27.64 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  28.21 
 
 
330 aa  63.9  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  25.42 
 
 
377 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  27.97 
 
 
379 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 
363 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  26.05 
 
 
359 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1260  oxidoreductase domain-containing protein  26.47 
 
 
372 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.140047  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.45 
 
 
337 aa  63.9  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 
331 aa  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  23.74 
 
 
376 aa  63.5  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 
344 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  24.6 
 
 
374 aa  63.5  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  27.75 
 
 
408 aa  63.2  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  24.8 
 
 
385 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  30.04 
 
 
378 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  25.94 
 
 
378 aa  63.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  22.08 
 
 
368 aa  63.2  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  24.89 
 
 
377 aa  63.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  26.64 
 
 
327 aa  63.2  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  23.21 
 
 
359 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  29.22 
 
 
371 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01210  predicted dehydrogenase  29.7 
 
 
319 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>