More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0616 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  88.89 
 
 		 387 aa  704    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0616  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 387 aa  805    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4013  oxidoreductase domain protein  66.93 
 
 		 382 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  66.15 
 
 		 382 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  64.84 
 
 		 382 aa  524  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  61.82 
 
 		 383 aa  497  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  61.24 
 
 		 383 aa  497  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  57.14 
 
 		 381 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  57.66 
 
 		 386 aa  454  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  56.74 
 
 		 385 aa  450  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  56.28 
 
 		 384 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  54.52 
 
 		 384 aa  442  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2017  oxidoreductase domain protein  55.56 
 
 		 384 aa  442  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2881  oxidoreductase domain-containing protein  58.18 
 
 		 381 aa  444  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  53.51 
 
 		 389 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  56.51 
 
 		 380 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  52.99 
 
 		 389 aa  437  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4009  oxidoreductase domain protein  57.14 
 
 		 381 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  53.75 
 
 		 387 aa  432  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  52.84 
 
 		 387 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1086  oxidoreductase domain protein  54.55 
 
 		 382 aa  426  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  54.26 
 
 		 387 aa  415  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  53.37 
 
 		 388 aa  396  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  23.65 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  28.08 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  26.91 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  32.89 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  34.62 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  31.28 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  31.94 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  30.36 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 		 386 aa  69.3  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  24.83 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  27.82 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  32 
 
 		 328 aa  67  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  29.69 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  27.93 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 		 359 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  30.28 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  27.98 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  25.21 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  25.52 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  21.41 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  22.98 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0394  oxidoreductase-like protein  29.9 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202174  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1739  oxidoreductase domain protein  24.68 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245731  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4117  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  23.73 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  24.34 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  22.99 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  29.07 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  26.39 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  29.27 
 
 		 346 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0261  oxidoreductase-like  29.8 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  24.68 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.23 
 
 		 319 aa  62  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  23.39 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  24.2 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  26.01 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  23.45 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  28.3 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  22.67 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  25.19 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  25.33 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  22.87 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  24.79 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  23.95 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0507  oxidoreductase domain-containing protein  29.45 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  23.95 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.839284 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  30.13 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  30.58 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  30.85 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  23.17 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  33.09 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  23.87 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  24.72 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  24.75 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  27.7 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  22.92 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  27.18 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  27.37 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  23.19 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  23.32 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65576  predicted protein  28.64 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>