More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2425 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  95.63 
 
 
389 aa  772    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
389 aa  801    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  89.09 
 
 
387 aa  701    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  75.32 
 
 
387 aa  625  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  73.77 
 
 
388 aa  590  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  64.66 
 
 
386 aa  504  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4009  oxidoreductase domain protein  62.14 
 
 
381 aa  497  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  61.52 
 
 
384 aa  485  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2017  oxidoreductase domain protein  62.11 
 
 
384 aa  484  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  61.21 
 
 
380 aa  475  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  58.85 
 
 
384 aa  476  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1086  oxidoreductase domain protein  61.58 
 
 
382 aa  475  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288482  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  59.43 
 
 
387 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  57.4 
 
 
383 aa  465  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  59.1 
 
 
383 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4013  oxidoreductase domain protein  58.01 
 
 
382 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  57.74 
 
 
382 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  56.96 
 
 
382 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  55.87 
 
 
381 aa  432  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  54.81 
 
 
387 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0616  oxidoreductase domain-containing protein  52.99 
 
 
387 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2881  oxidoreductase domain-containing protein  52.73 
 
 
381 aa  402  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  50.52 
 
 
385 aa  403  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  27.95 
 
 
396 aa  95.5  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 
396 aa  86.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  23.88 
 
 
376 aa  85.9  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  32.35 
 
 
324 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  27.51 
 
 
387 aa  84  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  34.08 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  29.51 
 
 
331 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  29.36 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  25.67 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  28.92 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  26.46 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01210  predicted dehydrogenase  33.51 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  31.18 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  27.99 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  28.63 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  29.67 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.09 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  24.54 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  36.36 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  25.74 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  25.62 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 
377 aa  72.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 
338 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  31.36 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1594  oxidoreductase domain protein  28.76 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 
369 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
372 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  33.6 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  33.6 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  27.5 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  29.87 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.8 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  29.01 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  30.95 
 
 
382 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  24.36 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  22.73 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3885  oxidoreductase, NAD-binding  29.27 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.432138  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  25.93 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  24.36 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  27.02 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03291  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  29.27 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0275  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3639  putative dehydrogenase  29.27 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.117542  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03244  hypothetical protein  29.27 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0273  putative dehydrogenase  29.27 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3918  putative dehydrogenase  29.27 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  24.68 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  26.82 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  24.34 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4757  putative dehydrogenase  29.27 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523048  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  30.92 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.43 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  29.71 
 
 
341 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.8 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  30.29 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  24.22 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  30.71 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  30.71 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  29.09 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  31.43 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.49 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  24.78 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  29.38 
 
 
379 aa  67.4  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>