More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1757 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 324 aa  674    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  69.44 
 
 		 327 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  53.4 
 
 		 331 aa  337  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  49.69 
 
 		 327 aa  330  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  51.69 
 
 		 354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  47.98 
 
 		 328 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  44.24 
 
 		 322 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2941  oxidoreductase domain-containing protein  37.85 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2322  oxidoreductase domain-containing protein  34.16 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 		 330 aa  112  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1364  oxidoreductase domain protein  29.12 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.95 
 
 		 331 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  31.44 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  34.56 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  28.81 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 		 347 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  29.39 
 
 		 329 aa  106  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  30 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  29.84 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  30.08 
 
 		 343 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  32.9 
 
 		 358 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  31.89 
 
 		 369 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  32.32 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 		 332 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  32.2 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  27.63 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  33.71 
 
 		 667 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  23.81 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  32.2 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  25.19 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 		 321 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  34.69 
 
 		 338 aa  99.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 		 321 aa  99.8  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  30.93 
 
 		 320 aa  99.8  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  29.13 
 
 		 405 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 396 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  26.73 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 373 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 		 343 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  27.07 
 
 		 388 aa  97.8  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  25.62 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 		 370 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 		 370 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  30.99 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  29.43 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  27.05 
 
 		 349 aa  97.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  36.3 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  33.1 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 		 359 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 		 350 aa  97.1  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 		 359 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  34.69 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  28.23 
 
 		 325 aa  96.7  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 		 359 aa  96.3  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  32 
 
 		 375 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.68 
 
 		 338 aa  96.3  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  27.2 
 
 		 324 aa  96.3  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  25.41 
 
 		 384 aa  95.9  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  27.34 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0790  putative oxidoreductase  31.89 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  27.2 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  27.1 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  33.64 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 		 468 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  35.42 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.95 
 
 		 353 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  29.52 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  30.73 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  26.96 
 
 		 334 aa  95.1  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 		 353 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  29.78 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 		 346 aa  94  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08461  putative oxidoreductase  29.09 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336432  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  28.52 
 
 		 360 aa  93.6  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 331 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 341 aa  93.2  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  27.31 
 
 		 327 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 		 362 aa  93.2  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  28.22 
 
 		 345 aa  93.2  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  29.18 
 
 		 338 aa  93.2  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 		 365 aa  92.8  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  32.63 
 
 		 360 aa  92.8  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  30.71 
 
 		 667 aa  92.4  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 		 667 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.84 
 
 		 335 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>