More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1023 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 327 aa  631  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  55.09 
 
 		 331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  54.08 
 
 		 342 aa  293  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  53.52 
 
 		 343 aa  277  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  51.67 
 
 		 342 aa  276  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  51.66 
 
 		 342 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3430  oxidoreductase domain protein  54.55 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0734143  normal  0.0102685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  32.46 
 
 		 334 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  32.01 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  33.02 
 
 		 345 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.67 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.01 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  34.07 
 
 		 330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  34.6 
 
 		 322 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  33.66 
 
 		 336 aa  115  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  32.47 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  30.39 
 
 		 334 aa  112  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  30.4 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  30.48 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  28.97 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  32.7 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  28.05 
 
 		 331 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  33.85 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  33.22 
 
 		 349 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  25.81 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  31.14 
 
 		 435 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  32.2 
 
 		 435 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  38.38 
 
 		 334 aa  96.7  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2941  oxidoreductase domain-containing protein  36.27 
 
 		 324 aa  96.3  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  32.69 
 
 		 336 aa  96.3  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  40.17 
 
 		 346 aa  95.9  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  32.38 
 
 		 330 aa  95.9  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  32.7 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  28.57 
 
 		 438 aa  94.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  24.84 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 		 354 aa  93.6  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  28.67 
 
 		 433 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  31.47 
 
 		 326 aa  93.6  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  28.18 
 
 		 468 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  34.48 
 
 		 363 aa  93.6  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  30.27 
 
 		 435 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  34.8 
 
 		 330 aa  93.2  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  37.38 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  31.43 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  33.85 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  31.49 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  31.96 
 
 		 405 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 		 458 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  33.46 
 
 		 356 aa  89.7  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  36.27 
 
 		 350 aa  89.4  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  31 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  30.74 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  35.98 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  30.94 
 
 		 387 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  30.21 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01210  predicted dehydrogenase  34.42 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  31.4 
 
 		 395 aa  86.7  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  37.69 
 
 		 352 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  40.13 
 
 		 371 aa  86.3  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  32.42 
 
 		 432 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  35.81 
 
 		 373 aa  85.9  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  32.4 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  27.65 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  27.71 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  34.55 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  32.76 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  32.05 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  31.16 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  37.19 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  34.04 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  29.21 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  31.2 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  33.98 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01970  predicted dehydrogenase  27.17 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.395105 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  31.5 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.52 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  32.21 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3840  oxidoreductase domain protein  34.59 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0183731  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  32.21 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  26.34 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  31.05 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  32.44 
 
 		 419 aa  82.8  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  31.22 
 
 		 667 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  30.92 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  28.72 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  32.69 
 
 		 374 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  27.71 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  30.41 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  30.41 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>