More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1242 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
328 aa  652    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1659  oxidoreductase domain protein  43.9 
 
 
351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  43.21 
 
 
337 aa  202  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  40.67 
 
 
330 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  30.84 
 
 
325 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  31.5 
 
 
329 aa  135  7.000000000000001e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  32.62 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.04 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  28.29 
 
 
387 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  28.73 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  28.73 
 
 
341 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.68 
 
 
341 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  28.73 
 
 
341 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.03 
 
 
335 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.89 
 
 
313 aa  106  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
354 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  34.72 
 
 
330 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 
359 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  26.96 
 
 
350 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  31.89 
 
 
334 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.42 
 
 
329 aa  99.4  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  31.06 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 
353 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  30.77 
 
 
343 aa  97.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  26.64 
 
 
353 aa  96.3  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.55 
 
 
312 aa  96.3  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0356  oxidoreductase domain-containing protein  27.16 
 
 
341 aa  96.3  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  26.2 
 
 
356 aa  95.9  8e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 
357 aa  95.1  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  30.15 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  28.49 
 
 
358 aa  95.5  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  31.4 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  33.03 
 
 
323 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  31.45 
 
 
331 aa  93.6  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3492  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  37.73 
 
 
339 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00854332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6869  oxidoreductase YdgJ  34.14 
 
 
345 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  34.54 
 
 
340 aa  93.2  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  30.5 
 
 
342 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 
326 aa  92.4  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  22.41 
 
 
347 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  23.76 
 
 
366 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  36.17 
 
 
333 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  31.35 
 
 
347 aa  91.3  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.04 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  32.12 
 
 
333 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  29.94 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  29.72 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
337 aa  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  30.82 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.04 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  29.54 
 
 
386 aa  90.5  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  31.16 
 
 
334 aa  90.9  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  29.46 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.62 
 
 
328 aa  90.1  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 
345 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 
355 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  29.7 
 
 
335 aa  90.1  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  33.16 
 
 
369 aa  90.1  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  29.25 
 
 
333 aa  90.1  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  24.56 
 
 
360 aa  89.7  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  30.7 
 
 
368 aa  89.4  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  23.48 
 
 
311 aa  89.4  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  28.15 
 
 
334 aa  89.4  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  29.58 
 
 
393 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  27.54 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  31.38 
 
 
343 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  36.02 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.86 
 
 
329 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1925  oxidoreductase domain protein  30.85 
 
 
351 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000551869  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  28.22 
 
 
337 aa  87.8  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  31.16 
 
 
337 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  27.11 
 
 
331 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  28.94 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  24.32 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 
345 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  31.27 
 
 
342 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  26.98 
 
 
328 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  29.63 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  29.67 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  29.08 
 
 
331 aa  87.4  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  31.46 
 
 
385 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  25.51 
 
 
337 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  23.74 
 
 
358 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  29.96 
 
 
334 aa  87  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3266  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  37.16 
 
 
339 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.48 
 
 
334 aa  86.7  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  33.62 
 
 
357 aa  86.3  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  24.25 
 
 
359 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  26.89 
 
 
310 aa  85.9  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  29.97 
 
 
349 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 
345 aa  85.9  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 
328 aa  85.9  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  27.47 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  24.62 
 
 
354 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  36.22 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  24.71 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>