More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2124 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
337 aa  661    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  51.1 
 
 
330 aa  285  7e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1659  oxidoreductase domain protein  50.31 
 
 
351 aa  275  9e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  42.9 
 
 
328 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  34.97 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  38.62 
 
 
326 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  31.32 
 
 
329 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 
353 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  29.49 
 
 
387 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  28.2 
 
 
359 aa  102  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.15 
 
 
312 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  29.72 
 
 
346 aa  99.8  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.23 
 
 
359 aa  99.8  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  32.2 
 
 
345 aa  99.8  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  30.63 
 
 
345 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.01 
 
 
349 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  26.15 
 
 
310 aa  98.2  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.15 
 
 
313 aa  97.4  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  26.71 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  30.56 
 
 
331 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.46 
 
 
329 aa  94.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  31.69 
 
 
343 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  23.3 
 
 
360 aa  94.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  23.3 
 
 
360 aa  94.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 
331 aa  94  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 
333 aa  93.6  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  25.81 
 
 
350 aa  93.2  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  32.99 
 
 
349 aa  93.2  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  26.96 
 
 
357 aa  92.8  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.21 
 
 
341 aa  92.8  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  27.21 
 
 
341 aa  92.4  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  27.21 
 
 
341 aa  92.4  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  29.49 
 
 
347 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  25.75 
 
 
362 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  29.68 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  32.46 
 
 
330 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.43 
 
 
330 aa  90.5  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.87 
 
 
341 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.14 
 
 
328 aa  90.5  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 
347 aa  89.4  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  22.97 
 
 
374 aa  89.4  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  35.6 
 
 
356 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  36.79 
 
 
351 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  32.66 
 
 
356 aa  88.6  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  36.79 
 
 
347 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  26.53 
 
 
361 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  30.21 
 
 
359 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  29.96 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  30.21 
 
 
359 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  36.79 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  36.79 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  36.79 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  32.97 
 
 
353 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  28.42 
 
 
334 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  36.79 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  36.79 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2996  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 
359 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.734865  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 
331 aa  87  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  36.79 
 
 
351 aa  87  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  35.53 
 
 
342 aa  87  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 
331 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  26.62 
 
 
341 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3268  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.38 
 
 
336 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00502229  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  27.82 
 
 
344 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  28.14 
 
 
335 aa  86.7  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.82 
 
 
334 aa  86.7  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 
333 aa  86.7  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  31.13 
 
 
340 aa  86.3  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  32.8 
 
 
332 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.32 
 
 
337 aa  86.3  7e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 
337 aa  86.3  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  23.32 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  25.75 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  30.22 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  36.13 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  28.13 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  28.26 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  28.8 
 
 
342 aa  84  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3494  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.88 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0220757  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  29.97 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  33.84 
 
 
338 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  27.94 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  27.49 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  28.44 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  27.68 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  23.77 
 
 
341 aa  82.8  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  25.22 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  30.73 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.38 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  26.1 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.27 
 
 
333 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  28.91 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  30 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.56 
 
 
333 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  26.29 
 
 
356 aa  82  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>