More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2996 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2996  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 359 aa  731    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.734865  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  30.39 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  27.69 
 
 		 338 aa  92.8  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.13 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  28.62 
 
 		 330 aa  89.4  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.35 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  32.54 
 
 		 366 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 		 329 aa  86.3  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  25.54 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  32.95 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  34.44 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  32.16 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  32.16 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1659  oxidoreductase domain protein  32.58 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  34.03 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  34.11 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  34.72 
 
 		 348 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  34.11 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.2 
 
 		 356 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  34.03 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  30.87 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  36.03 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  34.44 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  30.11 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  28.37 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.34 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  28.37 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  28.37 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  28.37 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  28.37 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  30.64 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  34.72 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.4 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.99 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  30.99 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  30.99 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  26.03 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  31.74 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  29.87 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  33.33 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  28.03 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  30.91 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  28.31 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  31.94 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  34.5 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  30.48 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  31.94 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  29.22 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  31.94 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  31.94 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  30.3 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.11 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  31.94 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  43.62 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  35.87 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  28.67 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.6 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  33.94 
 
 		 387 aa  72.8  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  32.87 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  25.69 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  29.24 
 
 		 333 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  37.08 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  31.01 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 360 aa  72  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  31.79 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  29.6 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.18 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  30.91 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  38.71 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  27.84 
 
 		 343 aa  72  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  31.25 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  31.25 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  38.89 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  23.94 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  30.57 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  29.79 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2026  oxidoreductase domain-containing protein  26.95 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  23.02 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  28.64 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  35.11 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  29.68 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  26.13 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>