More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1659 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1659  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
351 aa  689    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  50.31 
 
 
337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  45.9 
 
 
330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  39.82 
 
 
325 aa  224  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  43.71 
 
 
328 aa  216  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  36.39 
 
 
326 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  34.75 
 
 
329 aa  151  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.81 
 
 
353 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.24 
 
 
329 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 
387 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.78 
 
 
328 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  31.37 
 
 
327 aa  100  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  32.18 
 
 
339 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  30.84 
 
 
334 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1925  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 
351 aa  96.3  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000551869  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  31.12 
 
 
326 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  31.09 
 
 
338 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  29.26 
 
 
340 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  32.47 
 
 
339 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  31.09 
 
 
331 aa  90.9  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  28.94 
 
 
341 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  28.94 
 
 
341 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.84 
 
 
342 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  29.71 
 
 
338 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  31.67 
 
 
330 aa  90.9  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.94 
 
 
341 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  28.57 
 
 
341 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  30.56 
 
 
336 aa  90.5  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 
334 aa  89.7  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  32.47 
 
 
339 aa  89.4  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.47 
 
 
339 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.06 
 
 
337 aa  89.4  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  32.47 
 
 
339 aa  89.4  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  32.47 
 
 
339 aa  89.4  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  32.47 
 
 
339 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  32.47 
 
 
339 aa  89.4  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  30.36 
 
 
331 aa  89  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  31.09 
 
 
330 aa  89  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.89 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  31.21 
 
 
329 aa  87.8  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  30.25 
 
 
358 aa  87  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  28.66 
 
 
336 aa  87  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  30.3 
 
 
316 aa  86.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  25.59 
 
 
347 aa  86.7  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 
330 aa  86.7  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  28.78 
 
 
334 aa  86.7  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  37.76 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 
347 aa  85.9  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  29.55 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  27.83 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  33.51 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  29.97 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  31.96 
 
 
328 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  27.83 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.74 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  30.32 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  31.25 
 
 
345 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  31.25 
 
 
345 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  31.25 
 
 
345 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3819  oxidoreductase-like  29.48 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.3 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  29.06 
 
 
432 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  29.48 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  27.15 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  30.19 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  28.49 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  30.88 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  30.88 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.03 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  31.96 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.96 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  31.96 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  31.12 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.66 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2996  oxidoreductase domain protein  32.58 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.734865  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  27.11 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  30.8 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  30.96 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  29.71 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  31.3 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  30.77 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2344  oxidoreductase domain-containing protein  30.54 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  27.73 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  31.07 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  29.29 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  26.86 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  27.04 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  32.03 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.77 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  30.4 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  26.32 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  30.86 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  24.5 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>