More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00380 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 330 aa  660    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  51.1 
 
 		 337 aa  285  8e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1659  oxidoreductase domain protein  45.9 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  37.12 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  40.67 
 
 		 328 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  35.26 
 
 		 326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  30.63 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  31.95 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  30.9 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 		 330 aa  105  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  30.88 
 
 		 335 aa  102  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  30.53 
 
 		 343 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  29.71 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  32.33 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.3 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  29.79 
 
 		 345 aa  99.8  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  27.14 
 
 		 356 aa  99.4  8e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  30.36 
 
 		 346 aa  99  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  32.17 
 
 		 332 aa  99.4  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  32.76 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  29.88 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  26.89 
 
 		 387 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  35.05 
 
 		 369 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  31.75 
 
 		 358 aa  95.9  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  29.93 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 		 345 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  34.8 
 
 		 355 aa  95.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  27.63 
 
 		 341 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  30.74 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  26.75 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  32.36 
 
 		 339 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 		 337 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  30.77 
 
 		 332 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  29.45 
 
 		 332 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 		 331 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.63 
 
 		 341 aa  92.4  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.53 
 
 		 313 aa  92.4  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  27.63 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  27.63 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  32 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  32 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  32 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  32 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  32 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  31.96 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  32 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.95 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  28.93 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  32.46 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  36 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  28.02 
 
 		 331 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 		 344 aa  90.1  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2996  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 		 359 aa  89.4  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.734865  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  27.01 
 
 		 356 aa  89.4  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.38 
 
 		 334 aa  89  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.97 
 
 		 330 aa  89  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  33.45 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1254  oxidoreductase domain protein  41.09 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  37.37 
 
 		 338 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  31.94 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  29.6 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  29.49 
 
 		 338 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  30.23 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  30.23 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  34.51 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  34.13 
 
 		 344 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 		 349 aa  87  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  30.26 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  28.15 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  30.26 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  34.87 
 
 		 340 aa  86.7  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  25.95 
 
 		 342 aa  86.3  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  31.07 
 
 		 328 aa  86.3  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2924  oxidoreductase domain-containing protein  32.26 
 
 		 354 aa  86.3  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  24.18 
 
 		 363 aa  85.9  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  29.92 
 
 		 344 aa  85.9  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  34.78 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  25.93 
 
 		 359 aa  85.9  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  24.04 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  31.01 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  27.87 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  25.67 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1674  oxidoreductase domain protein  36.43 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0873607  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.01 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  31.01 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 		 330 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  33.51 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  29.77 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.04 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>