More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3819 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3819  oxidoreductase-like  100 
 
 		 341 aa  699    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  63.58 
 
 		 345 aa  408  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3954  oxidoreductase domain protein  48.47 
 
 		 341 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1313  oxidoreductase domain-containing protein  49.11 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  32.44 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 351 aa  143  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4755  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00177574  normal  0.507858 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3394  oxidoreductase domain protein  31.85 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  27.76 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  31.68 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  27.15 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  27.15 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  29.46 
 
 		 331 aa  103  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.91 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  25.61 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 		 325 aa  93.6  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  26.25 
 
 		 330 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  25.28 
 
 		 368 aa  90.1  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  26.65 
 
 		 335 aa  87.4  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 		 330 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.89 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  32.83 
 
 		 342 aa  86.7  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  22.22 
 
 		 325 aa  85.9  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.74 
 
 		 329 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  33.01 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  27.96 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  22.19 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50110  Myo-inositol 2-dehydrogenase  27.62 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  31.62 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1246  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase signal peptide protein  32.34 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.405196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  33.84 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  26.51 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  28.92 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1659  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.3 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  22.94 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  29 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  27.81 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  24.63 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  24.54 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  26.78 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  25.81 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  29.49 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  23.13 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  30.3 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  31 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11260  oxidoreductase domain protein  24.84 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.305619  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0825  inositol 2-dehydrogenase  25.27 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  29.06 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  27.78 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  27.99 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  27.34 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  26.16 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  21.66 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  26.63 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  32.87 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3178  oxidoreductase domain protein  33.77 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1379  oxidoreductase-like protein  24.77 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  29.39 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  21.5 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  31.4 
 
 		 362 aa  75.9  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.72 
 
 		 312 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  23.12 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  24.4 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1887  inositol 2-dehydrogenase  26.92 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.28659 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  27.05 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  27.52 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.52 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  29.75 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  23.68 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  27.52 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  25.25 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  31 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  24.58 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  24.33 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  26.44 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  22.57 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  20.99 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  27.16 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  22.29 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.49 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  25.43 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0302  oxidoreductase domain protein  31.37 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00604537  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  21.62 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  25.07 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  23.95 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  27.19 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  26.02 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3494  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.32 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0220757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>