More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4658 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4755  oxidoreductase domain protein  90.7 
 
 
344 aa  659    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00177574  normal  0.507858 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
344 aa  712    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  81.1 
 
 
344 aa  595  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  68.22 
 
 
352 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  59.21 
 
 
351 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  50.62 
 
 
343 aa  344  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  37.01 
 
 
344 aa  238  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1313  oxidoreductase domain-containing protein  32.58 
 
 
347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3394  oxidoreductase domain protein  34.21 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3819  oxidoreductase-like  29.85 
 
 
341 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 
345 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 
369 aa  125  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3954  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 
341 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  27.95 
 
 
368 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 
355 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  30.36 
 
 
345 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  25.61 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 
364 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  26.54 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1905  oxidoreductase domain protein  26.99 
 
 
347 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 
337 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  24.93 
 
 
387 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  26.24 
 
 
360 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  26.03 
 
 
348 aa  97.1  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 
366 aa  96.3  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 
353 aa  95.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  28.36 
 
 
366 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  23.03 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  24.68 
 
 
356 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  26.88 
 
 
367 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 
347 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 
396 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 
347 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  24.45 
 
 
349 aa  89.4  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  27.27 
 
 
404 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  26.57 
 
 
363 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 
377 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  22.83 
 
 
363 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  24.1 
 
 
347 aa  87  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.03 
 
 
347 aa  87  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
356 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 
366 aa  86.7  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  25.64 
 
 
376 aa  86.7  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  24.66 
 
 
366 aa  86.3  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  24.8 
 
 
387 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  25.85 
 
 
342 aa  85.5  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  25.88 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 
363 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0274  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0737  oxidoreductase domain-containing protein  26.98 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  24.8 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  25.92 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  28.45 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  29.81 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  26.38 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.71 
 
 
331 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.08 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  24.02 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  26.14 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  28.29 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  30.37 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  24.45 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  26.53 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  25.87 
 
 
358 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  25.39 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.45 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.54 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0294  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.950002  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  24.06 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  26.63 
 
 
350 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 
373 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  22.97 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
328 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 
331 aa  79  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  23.4 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  23.34 
 
 
376 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  23.34 
 
 
376 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  26.72 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  23.86 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  27.73 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  22.06 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  28.46 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  25.94 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  26.63 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01970  predicted dehydrogenase  27.47 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.395105 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  28.29 
 
 
336 aa  77  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.98 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  28.28 
 
 
385 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>