More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24600 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  100 
 
 
366 aa  733    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  76.55 
 
 
366 aa  534  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  51.96 
 
 
367 aa  348  7e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  45.33 
 
 
364 aa  326  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  35.07 
 
 
359 aa  229  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  34.36 
 
 
359 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  30.28 
 
 
349 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  35.05 
 
 
369 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  35.8 
 
 
359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  35.51 
 
 
355 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  33.88 
 
 
356 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  35.57 
 
 
358 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  35.22 
 
 
353 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 
348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1537  oxidoreductase domain protein  38.29 
 
 
356 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 
377 aa  169  7e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  31.93 
 
 
347 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  33.24 
 
 
340 aa  162  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  33.8 
 
 
354 aa  162  9e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  29.72 
 
 
360 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  31.18 
 
 
355 aa  156  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  34.83 
 
 
374 aa  155  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  34.85 
 
 
371 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  31.48 
 
 
351 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0747  oxidoreductase domain-containing protein  30.27 
 
 
358 aa  152  7e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 
355 aa  152  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
362 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 
351 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  30.7 
 
 
351 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  30.7 
 
 
347 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  30.92 
 
 
351 aa  146  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  30.7 
 
 
351 aa  146  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  30.7 
 
 
351 aa  146  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  30.7 
 
 
351 aa  146  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  30.7 
 
 
351 aa  146  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4124  oxidoreductase domain protein  37.28 
 
 
369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0425  oxidoreductase domain protein  35.62 
 
 
369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  30.47 
 
 
359 aa  136  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  30.47 
 
 
359 aa  136  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2849  oxidoreductase domain-containing protein  29.33 
 
 
349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  29.56 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  32.67 
 
 
357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  30 
 
 
312 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3350  oxidoreductase domain protein  31.02 
 
 
383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.564289  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2464  oxidoreductase domain-containing protein  29.13 
 
 
347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.570958  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 
347 aa  125  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 
346 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 
346 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 
376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  28.26 
 
 
404 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  32.84 
 
 
333 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 
353 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4840  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
416 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  32.37 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 
347 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  25.19 
 
 
394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 
377 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  32.47 
 
 
333 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 
377 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  30.26 
 
 
366 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  24.87 
 
 
385 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 
393 aa  106  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  31.69 
 
 
337 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 
377 aa  106  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
395 aa  105  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1063  oxidoreductase-like protein  32.04 
 
 
337 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  30.19 
 
 
376 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  27.7 
 
 
390 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  28.68 
 
 
378 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  31.13 
 
 
378 aa  104  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  29.73 
 
 
376 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5577  oxidoreductase domain protein  27.34 
 
 
342 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.275125 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0430  oxidoreductase-like  30.14 
 
 
376 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  31.34 
 
 
337 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  30.19 
 
 
379 aa  102  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 
377 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1256  oxidoreductase domain-containing protein  29.93 
 
 
357 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  30.19 
 
 
377 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.19 
 
 
377 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  30.19 
 
 
377 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  28.04 
 
 
388 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  29.56 
 
 
371 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  28.23 
 
 
356 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  28.94 
 
 
371 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 
340 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 
311 aa  99.8  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  27.35 
 
 
331 aa  99.8  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 
393 aa  99.4  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 
341 aa  99.4  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  27.32 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  28.95 
 
 
345 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  25.96 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  29.18 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.42 
 
 
385 aa  97.4  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  26.35 
 
 
313 aa  97.4  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  30.21 
 
 
349 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>