More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5752 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 362 aa  748    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3433  oxidoreductase domain-containing protein  65.27 
 
 		 363 aa  475  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.808299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  52.57 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  46.89 
 
 		 376 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  46.89 
 
 		 376 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  33.24 
 
 		 360 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2277  oxidoreductase domain-containing protein  31.2 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2752  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 359 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4126  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 		 352 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0315  oxidoreductase domain-containing protein  30.41 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500067  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0241  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.62 
 
 		 359 aa  116  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.803279  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4973  oxidoreductase domain-containing protein  29.06 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3482  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 		 352 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  25.96 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  31.84 
 
 		 347 aa  94  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0234  putative oxidoreductase protein  27.43 
 
 		 325 aa  92  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  27.67 
 
 		 351 aa  90.5  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1468  oxidoreductase-like  27.65 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 		 364 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  26.96 
 
 		 345 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 		 356 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 		 341 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4755  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 		 344 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00177574  normal  0.507858 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  25.88 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.04 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  24.83 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2038  oxidoreductase domain-containing protein  26.52 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17800  predicted dehydrogenase  26.52 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.50383  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  24.83 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  25.43 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 		 356 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  22.74 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.21 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  26.06 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3819  oxidoreductase-like  31 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  35.81 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  26.17 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  30.77 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  25.43 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  27.85 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3469  oxidoreductase domain-containing protein  24.08 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  23.66 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  28.06 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  28.07 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  21.86 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  23.08 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.77 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  25.49 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  27.04 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  27.4 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1313  oxidoreductase domain-containing protein  24.29 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3954  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.82 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  22.31 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  31.61 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1146  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 365 aa  67  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  33.56 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  22.88 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  23.77 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  32.43 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  27.82 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  25.89 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11260  oxidoreductase domain protein  22.53 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.305619  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  32.43 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  32.43 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  32.43 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  23.95 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  32.43 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  32.43 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2763  oxidoreductase-like  31.17 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.495555  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  31.76 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  27.78 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  26.47 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  29.41 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  26.47 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  32.43 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  28.86 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  28.86 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  27.75 
 
 		 734 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  26.86 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0268  dehydrogenase related protein  28.38 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  27.82 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  28.86 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  31.76 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  21.94 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  26.81 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  25.22 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0126496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>