More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0586 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
391 aa  778    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  59.9 
 
 
388 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  39.22 
 
 
383 aa  330  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  36.66 
 
 
355 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 
366 aa  179  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 
359 aa  173  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 
345 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  35.14 
 
 
371 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  36.36 
 
 
385 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  35.69 
 
 
400 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  32.76 
 
 
347 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  35.56 
 
 
361 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  30.73 
 
 
350 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  32.19 
 
 
365 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  28.81 
 
 
360 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  28.81 
 
 
360 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  32.11 
 
 
387 aa  152  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 
357 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  31.28 
 
 
375 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 
374 aa  149  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  33.33 
 
 
345 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  32.1 
 
 
357 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  28.24 
 
 
331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  32.67 
 
 
357 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  33.7 
 
 
361 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 
359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  32.02 
 
 
388 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  36.99 
 
 
373 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  32.6 
 
 
387 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  30.47 
 
 
356 aa  144  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 
358 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 
337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  29.66 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  25.69 
 
 
357 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  31.37 
 
 
412 aa  139  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  30.59 
 
 
350 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  31.93 
 
 
404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 
364 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  30.75 
 
 
353 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  25.56 
 
 
363 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  29.31 
 
 
342 aa  132  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 
341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  26.72 
 
 
370 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  32.96 
 
 
359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  31.04 
 
 
377 aa  126  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  31.14 
 
 
352 aa  126  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  32.37 
 
 
349 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  31.34 
 
 
356 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 
366 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  37.76 
 
 
335 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  32.46 
 
 
334 aa  123  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  31.38 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  31.45 
 
 
359 aa  119  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  29.72 
 
 
362 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  24.78 
 
 
326 aa  113  7.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  27.63 
 
 
339 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.26 
 
 
364 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 
383 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 
333 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  23.12 
 
 
333 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  28.77 
 
 
335 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 
389 aa  101  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22450  predicted dehydrogenase  29.49 
 
 
390 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  32.55 
 
 
349 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 
405 aa  100  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  26.73 
 
 
343 aa  99.4  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 
348 aa  97.4  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 
369 aa  97.1  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  30.99 
 
 
355 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 
347 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.26 
 
 
359 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  28.36 
 
 
359 aa  94  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  28.36 
 
 
359 aa  94  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1048  oxidoreductase domain-containing protein  22.82 
 
 
376 aa  93.2  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.448338  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0785  oxidoreductase domain protein  27.52 
 
 
388 aa  93.2  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  29.66 
 
 
341 aa  93.2  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  32.05 
 
 
356 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  27.25 
 
 
365 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3178  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 
337 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  33.33 
 
 
339 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.81 
 
 
356 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.43 
 
 
371 aa  90.9  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  28.86 
 
 
337 aa  90.5  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  33.17 
 
 
355 aa  90.5  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  23.75 
 
 
311 aa  90.1  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  27.07 
 
 
405 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.57 
 
 
312 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  27.75 
 
 
349 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  29.73 
 
 
359 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  26.04 
 
 
310 aa  87  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  30.81 
 
 
421 aa  87  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  22.22 
 
 
341 aa  87  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  35.48 
 
 
346 aa  86.3  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  30.42 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  30.45 
 
 
414 aa  86.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  33.01 
 
 
366 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>