More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4755 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4755  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
344 aa  711    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00177574  normal  0.507858 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  90.7 
 
 
344 aa  659    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  81.1 
 
 
344 aa  590  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  67.64 
 
 
352 aa  492  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  58.31 
 
 
351 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  48.75 
 
 
343 aa  326  3e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  37.98 
 
 
344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1313  oxidoreductase domain-containing protein  31.14 
 
 
347 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3394  oxidoreductase domain protein  33.14 
 
 
336 aa  135  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3819  oxidoreductase-like  29.25 
 
 
341 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3954  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  29.43 
 
 
368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 
355 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1905  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 
347 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  25.07 
 
 
366 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 
360 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  24.26 
 
 
353 aa  92.4  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.47 
 
 
345 aa  92.4  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  25.14 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 
353 aa  90.5  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  24.65 
 
 
337 aa  89.4  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 
326 aa  89.4  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  26.2 
 
 
376 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  24.59 
 
 
366 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  24.38 
 
 
348 aa  89  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  26.2 
 
 
376 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  23.34 
 
 
396 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  26.78 
 
 
362 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  27.01 
 
 
347 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  22.43 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  27.21 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  23.1 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  23.29 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  28.98 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  21.41 
 
 
359 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  26.3 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  26.52 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  23.56 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  23.62 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  24.3 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  22.19 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  24.16 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  23.81 
 
 
387 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  24.54 
 
 
376 aa  79.3  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  25.19 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01970  predicted dehydrogenase  28.04 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.395105 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  24.73 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  28.97 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0274  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  27.52 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  25.9 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  28.85 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  26.43 
 
 
435 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  27.62 
 
 
334 aa  77  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  26.43 
 
 
435 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  21.71 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  23.53 
 
 
362 aa  77  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  24.73 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.59 
 
 
329 aa  75.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  24.5 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  23.51 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  27.85 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3266  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  27.8 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  23.99 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.27 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  24.43 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2277  oxidoreductase domain-containing protein  27.52 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0737  oxidoreductase domain-containing protein  25.43 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  24.44 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  27.69 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  24.06 
 
 
385 aa  73.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  24.06 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  22.7 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  23.33 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.14 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  24.01 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  24.13 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 
435 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3492  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25 
 
 
339 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00854332  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  26.38 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  26.46 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  23.5 
 
 
331 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  24.48 
 
 
334 aa  72  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  23.69 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  24.54 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  25 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4112  oxidoreductase-like  23.01 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  27.85 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3433  oxidoreductase domain-containing protein  23.53 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.808299  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>