More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0414 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 376 aa  788    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  100 
 
 		 376 aa  788    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  48.07 
 
 		 368 aa  351  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3433  oxidoreductase domain-containing protein  46.43 
 
 		 363 aa  332  4e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.808299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  46.89 
 
 		 362 aa  333  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  32.41 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4126  oxidoreductase domain-containing protein  30.03 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2752  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 		 359 aa  139  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2277  oxidoreductase domain-containing protein  28.91 
 
 		 353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1468  oxidoreductase-like  26.9 
 
 		 373 aa  116  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  25.98 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3482  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  26.12 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3819  oxidoreductase-like  27.15 
 
 		 341 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0315  oxidoreductase domain-containing protein  28.01 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500067  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0241  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.25 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.803279  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4973  oxidoreductase domain-containing protein  27.12 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2038  oxidoreductase domain-containing protein  25.9 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  26.29 
 
 		 351 aa  94  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11260  oxidoreductase domain protein  24.45 
 
 		 349 aa  93.2  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.305619  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  26.52 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4755  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00177574  normal  0.507858 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  23.65 
 
 		 344 aa  87  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1313  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  23.08 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  25.48 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.24 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0234  putative oxidoreductase protein  25.29 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  24.17 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  22.28 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4112  oxidoreductase-like  25.59 
 
 		 345 aa  79.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3954  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 		 341 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 		 345 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  23.34 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  25.16 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  22.79 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  24.07 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  22.28 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  29.21 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  24.38 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  23.66 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  23.47 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  24.29 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  24.83 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  22.86 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2255  oxidoreductase domain-containing protein  24.05 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00678448 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0790  putative oxidoreductase  24.3 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  23.39 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.77 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  21.49 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  22.29 
 
 		 346 aa  72.8  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  22.4 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1636  oxidoreductase domain-containing protein  24.46 
 
 		 341 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  25.35 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  23.98 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.35 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  23.33 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  25.35 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08461  putative oxidoreductase  24.88 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336432  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  23.03 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08431  putative oxidoreductase  24.3 
 
 		 365 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  21.58 
 
 		 334 aa  72  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  22.49 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0389  oxidoreductase domain protein  24.12 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198864  decreased coverage  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  25.24 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3394  oxidoreductase domain protein  24.83 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  25.58 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  26.13 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  22.1 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  24.04 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0520  oxidoreductase domain-containing protein  24.24 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3442  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  20.22 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  26.84 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  21.4 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  20.87 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  23.89 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  26.87 
 
 		 341 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3305  oxidoreductase domain-containing protein  25.52 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192693 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  26.38 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  27 
 
 		 328 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  26.87 
 
 		 341 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  25.7 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2775  oxidoreductase domain protein  21.45 
 
 		 361 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0108511  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.4 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  19.55 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  22.82 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  24.77 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.819586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>