More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6514 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  93.39 
 
 
365 aa  709    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
364 aa  753    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  51.55 
 
 
361 aa  362  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  49.15 
 
 
356 aa  348  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  46.29 
 
 
365 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  47.41 
 
 
357 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  46.84 
 
 
357 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  32.67 
 
 
355 aa  185  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  34.31 
 
 
361 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  32.07 
 
 
385 aa  166  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  31.89 
 
 
400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 
366 aa  159  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  30.83 
 
 
366 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  29.92 
 
 
347 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  31.07 
 
 
404 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  28.94 
 
 
371 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  29.94 
 
 
383 aa  149  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  31.12 
 
 
373 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  30.79 
 
 
387 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  27.35 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  27.35 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  29.83 
 
 
388 aa  132  7.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 
391 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  28.61 
 
 
353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  29.97 
 
 
356 aa  126  6e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  29.91 
 
 
331 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 
350 aa  123  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  25.48 
 
 
350 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 
358 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  29.89 
 
 
349 aa  119  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  26.16 
 
 
353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  26.36 
 
 
359 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  33.76 
 
 
339 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  28.34 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  27.07 
 
 
343 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  29.24 
 
 
352 aa  109  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 
357 aa  109  8.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  29.09 
 
 
375 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  29.18 
 
 
387 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 
374 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 
377 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 
341 aa  107  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  28.43 
 
 
388 aa  106  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 
353 aa  105  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  31.78 
 
 
345 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  27.04 
 
 
357 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  31.14 
 
 
344 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 
356 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 
412 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  26.12 
 
 
369 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  26.98 
 
 
370 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  26.38 
 
 
335 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 
340 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  31.56 
 
 
366 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.14 
 
 
335 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  26.98 
 
 
363 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  25.98 
 
 
326 aa  97.1  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  30.8 
 
 
335 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1925  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 
351 aa  93.6  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000551869  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25.14 
 
 
347 aa  93.6  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  25.14 
 
 
358 aa  92.8  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  25.76 
 
 
349 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  29.73 
 
 
378 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 
337 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  26.07 
 
 
342 aa  92.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  28.63 
 
 
387 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  29.48 
 
 
341 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  29.24 
 
 
368 aa  90.5  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 
356 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  28.45 
 
 
330 aa  89.7  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  28.37 
 
 
330 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 
386 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 
387 aa  87.4  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  33.5 
 
 
364 aa  87  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 
333 aa  87  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  23.56 
 
 
344 aa  87  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 
387 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  26.59 
 
 
390 aa  86.3  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  31.02 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  27.73 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  28.23 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  31.25 
 
 
353 aa  84  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 
376 aa  84  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0737  oxidoreductase domain-containing protein  24.93 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  29.72 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1884  oxidoreductase domain-containing protein  25.32 
 
 
402 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  25.11 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.27 
 
 
341 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.27 
 
 
341 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 
367 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  27.47 
 
 
387 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  30.38 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  28.23 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  25.57 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.51 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>